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腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜及其在腦認(rèn)知與腦疾病方面的應(yīng)用

醫(yī)健AI掘金志 ? 來源:醫(yī)健AI掘金志 ? 作者:醫(yī)健AI掘金志 ? 2021-01-12 17:12 ? 次閱讀

網(wǎng)絡(luò)組圖譜提出后,歐盟人腦計(jì)劃(Human Brain Project, HBP)第一時(shí)間將其收錄。此外,國際著名神經(jīng)影像分析軟件,如SPM等,也將腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜作為主要人類腦圖譜提供給用戶使用。

雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》消息,近日,第四屆圖像計(jì)算與數(shù)字醫(yī)學(xué)國際研討會(huì)(ISICDM 2020),在遼寧省沈陽市的東北大學(xué)國際學(xué)術(shù)交流中心舉辦。

中科院自動(dòng)化所的蔣田仔教授以《The Human Brainnetome Atlas and its Applications in Understanding of Brain Functions and Disorders》為題作大會(huì)報(bào)告。

蔣田仔教授是歐洲科學(xué)院外籍院士、我國腦網(wǎng)絡(luò)組研究中心主任、腦網(wǎng)絡(luò)組重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任,同時(shí)也是IEEE Fellow、IAPR Fellow以及AIMBE Fellow。

他主要從事的領(lǐng)域包括多模態(tài)跨尺度腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜研究、基于腦網(wǎng)絡(luò)圖譜的腦機(jī)融合和腦疾病早期預(yù)測(cè)和精準(zhǔn)治療。

以下為蔣田仔教授的大會(huì)報(bào)告內(nèi)容。經(jīng)授權(quán),《醫(yī)健AI掘金志》作了不改變?cè)獾木庉嫼驼恚?/p>

蔣田仔:大家好,今天報(bào)告的題目叫《腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜及其在腦認(rèn)知與腦疾病方面的應(yīng)用》,將分為以下幾個(gè)方面:

首先,介紹什么是腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,接著重點(diǎn)介紹怎么繪制并驗(yàn)證圖譜,以及圖譜的應(yīng)用和對(duì)未來的展望。

在講腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜之前,首先要講一下什么叫腦網(wǎng)絡(luò)組。

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所謂腦網(wǎng)絡(luò)組(brainnetome)是由兩個(gè)基本要素構(gòu)成,一是網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)(node),二是節(jié)點(diǎn)跟節(jié)點(diǎn)的連接(connection)。

腦網(wǎng)絡(luò)組至少可以從三個(gè)不同的尺度進(jìn)行定義和研究:節(jié)點(diǎn)為神經(jīng)元(neuron)的微觀尺度、節(jié)點(diǎn)為神經(jīng)元群的介觀尺度(mesoscale)、節(jié)點(diǎn)為腦區(qū)的宏觀尺度。

從微觀尺度看,人腦有1011個(gè)神經(jīng)元和1015個(gè)連接,所以如果要從微觀尺度研究全腦是不可能的,至少以目前的計(jì)算資源是無法做到的。以后如果出現(xiàn)量子計(jì)算機(jī)什么的才有可能。

更小的規(guī)模就是介觀尺度。介觀尺度以目前的算力和計(jì)算水平也達(dá)不到全腦研究的要求。

今天要講的主要是宏觀尺度。宏觀尺度就是連接腦區(qū),在腦區(qū)跟腦區(qū)之間可以定義解剖連接(anatomical connectivity)、功能連接(functional connectivity)等等。

我認(rèn)為腦網(wǎng)絡(luò)組至少包括以下五個(gè)方面的研究內(nèi)容。

第一個(gè)方面是網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu);

第二個(gè)方面是網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律;

第三個(gè)方面是不同的腦功能,如功能異常在網(wǎng)絡(luò)上是怎么表征的;

第四個(gè)方面是一些特定的網(wǎng)絡(luò)。如跟智力、注意等相關(guān)的網(wǎng)絡(luò)是否有遺傳基礎(chǔ);

第五個(gè)方面是對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行仿真與建模;

如果大家對(duì)腦網(wǎng)絡(luò)組有興趣,可以去看我于2013年發(fā)表在《NeuroImage》上的一篇文章《Brainnetome:A new -ome to understand the brain and its disorders》,里面詳細(xì)介紹了什么叫腦網(wǎng)絡(luò)組,以及一些腦網(wǎng)絡(luò)組研究的基本內(nèi)容。

下面再回到今天的主題,腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜。

我認(rèn)為所謂的腦圖譜繪制,某種意義上就是圖像處理。它是在尋找具有不同特性的腦區(qū)之間的邊界,某種意義上就是一種圖像分割。

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最早的圖譜叫Brodmann圖譜。目前而言,該圖譜是腦認(rèn)知及腦疾病研究中使用得比較多的圖譜。

Brodmann圖譜主要是基于細(xì)胞構(gòu)筑進(jìn)行繪制的腦圖譜。

細(xì)胞構(gòu)筑的意思就是看細(xì)胞的形狀。這一片跟那一片的形狀長得很類似,他們認(rèn)為就在同一個(gè)腦區(qū);這一片跟另一片在形狀上有明顯的不同,他們就認(rèn)為在不同的腦區(qū)。這就是Brodmann圖譜繪制的基本思想。

Brodmann把皮層分成了52個(gè)不同的區(qū)域。現(xiàn)在看來,這個(gè)分區(qū)是非常粗糙的,而且有好多邊界其實(shí)是錯(cuò)的。

1996年前后,德國于利希研究中心(Forschungszentrum Jülich)下面的神經(jīng)科學(xué)與醫(yī)學(xué)研究所(Institute of Neuroscience and Medicine)就是想改造Brodmann圖譜。

這個(gè)研究所用的思想跟Brodmann是完全一樣的,還是把去世后的人捐獻(xiàn)的腦袋切成一片片,然后染色,看每一片上面的邊界在什么地方,再將它組成三維的。

這項(xiàng)研究從1996年到現(xiàn)在,二十多年過去了,盡管已經(jīng)在《Science》上發(fā)表了兩篇文章,但仍然沒有完成全腦圖譜的繪制。

因?yàn)橛幸恍┠X區(qū)的細(xì)胞構(gòu)筑比較復(fù)雜,很容易就能把它分成不同的類型;但還有一些腦區(qū)的細(xì)胞類型非常一致,這樣的腦區(qū),如果完全基于細(xì)胞構(gòu)筑的話,是沒辦法區(qū)分開的。

2010年左右,我們開始醞釀中國的973項(xiàng)目,設(shè)想的第一件事就是要用五年左右的時(shí)間重新繪制一個(gè)腦圖譜。

當(dāng)時(shí)如果完全沿用國外原有的腦圖譜繪制思想是不可能完成的。因?yàn)閲庾隽四敲撮L時(shí)間都沒有完成,我們?cè)趺纯赡芪迥昃湍芡瓿伞?/p>

所以我們走了一條完全不一樣的道路。

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圖像處理相關(guān)領(lǐng)域的人應(yīng)該都了解,腦圖像的基本單元不是一個(gè)個(gè)細(xì)胞,到不了那個(gè)程度。腦圖像的基本單位并不是細(xì)胞,而是體素。二維圖像的最小單位是像素,三維的最小單位就是體素。

腦圖像跟其他圖像有一個(gè)本質(zhì)的區(qū)別,那就是腦圖像的每一個(gè)體素都可以定義跟全腦其他體素之間的連接。所以只要拿一個(gè)體素出來,就可以定義它在全腦的連接,即所謂的連接模式(Connectivity Profile)。

有了這個(gè)東西以后,就可以比較體素和體素之間的連接模式是否一樣。連接模式一樣的話,那么它們就在同一個(gè)區(qū)域里;不一樣的話,就在不同的腦區(qū)。

這就是腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜繪制的最基本的思想。

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首先,需要有人的磁共振圖像以及結(jié)構(gòu)像。如果要進(jìn)一步定義連接模式,除了結(jié)構(gòu)像以外,我們還需要用于定義解剖連接的彌散磁共振成像,以及可以定義功能連接的功能磁共振成像。

經(jīng)過反復(fù)的論證,我們認(rèn)為只有解剖連接才有可能作為繪制圖譜的工具。

由于功能連接會(huì)受各種各樣的因素影響,尤其是時(shí)間因素——早上跟晚上采集的,功能上有可能也不一樣,這種隨時(shí)間動(dòng)態(tài)變化的東西,是沒辦法用于繪制圖譜的。所以我們使用的是彌散磁共振成像。

我們花了大概兩年時(shí)間——由于不同的腦區(qū)有著不一樣的特性,繪制全腦的圖譜還是面臨著很多挑戰(zhàn)——建立了腦圖譜繪制的框架。有了這個(gè)框架以后,就可以對(duì)不同的腦區(qū)進(jìn)行劃分。

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像內(nèi)后皮質(zhì)(posteromedial cortex)這個(gè)區(qū)域(左上圖藍(lán)色部分)的細(xì)胞構(gòu)筑非常復(fù)雜,用細(xì)胞構(gòu)筑去區(qū)分腦區(qū)是沒有任何問題的。但是剛才說了,我們希望能夠走另外一條道路。

所以,我們基于彌散磁共振成像來看這個(gè)區(qū)域跟前額的連接,把它建立起來以后,發(fā)現(xiàn)這個(gè)腦區(qū)可以分成五個(gè)不同的亞區(qū)。

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這個(gè)方法跟傳統(tǒng)的方法相比有一個(gè)最大的好處,就是不僅能夠提供分區(qū)——這是傳統(tǒng)腦圖譜繪制的最終目標(biāo),還能夠提供每一個(gè)亞區(qū)跟全腦其他腦區(qū)之間的連接模式——這個(gè)就叫連接圖譜。

所謂腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,就是比以前更加精細(xì)的分區(qū),加上每一個(gè)腦區(qū)跟全腦區(qū)來連接的連接圖譜。我們不叫它腦圖譜,這個(gè)意義也就在這個(gè)地方。

這個(gè)例子就告訴我們,傳統(tǒng)的基于細(xì)胞構(gòu)筑的方法能做的事情,腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜也能做。但是腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜能夠提供更多的信息。這個(gè)信息就是連接圖譜。這是第一點(diǎn)。

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對(duì)于一些細(xì)胞構(gòu)筑比較單一的腦區(qū),如顳極這個(gè)區(qū)域就可以利用連接模式,把它分成三個(gè)不同的亞區(qū)。這三個(gè)不同亞區(qū)的連接模式是完全不一樣的。

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這就是功能連接模式的指紋圖,這三個(gè)不同的亞區(qū)跟全腦的連接完全不同。我們不光可以定義它的解剖連接,也可以基于三個(gè)亞區(qū)定義它的功能連接。

這個(gè)例子說明,傳統(tǒng)的方法,即完全基于細(xì)胞構(gòu)筑去做分區(qū)的方法是區(qū)分不開的,但是利用連接模式就可以把它分成不同的亞區(qū)。傳統(tǒng)方法做不到的事情,我們能夠做到。

我們?cè)?016年完成了對(duì)全腦的皮層和皮層下的分區(qū)。皮層分成210個(gè)不同的亞區(qū),皮層下分成了36個(gè)不同亞區(qū),加在一起就是246個(gè)不同亞區(qū)。這就是腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜的分區(qū)結(jié)果。

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左邊這個(gè)圖的下方和右邊最上方提示的就是連接圖譜。

圓環(huán),就是相當(dāng)于把246個(gè)亞區(qū)放在一個(gè)圓環(huán)上面,點(diǎn)擊任何一個(gè)亞區(qū)就能夠展示跟全腦其他地方是怎么連接的。包括右邊那個(gè)可以動(dòng)來動(dòng)去的圖,也可以展示不同亞區(qū)的連接模式是什么樣的。

這個(gè)工作出來以后在國際上引起了一些非常重要的反響。George Paxinos就認(rèn)為腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜實(shí)際上開辟了腦圖譜繪制的新篇章。

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現(xiàn)在,腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜相關(guān)的軟件也已經(jīng)開放共享給國內(nèi)外相關(guān)研究領(lǐng)域的科研人員和臨床醫(yī)生免費(fèi)使用。

腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜出來以后,歐盟人腦計(jì)劃(Human Brain Project, HBP)第一時(shí)間就將它收錄到了平臺(tái)里面。此外,一些國際著名神經(jīng)影像分析軟件,如SPM,也將腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜作為主要人類腦圖譜提供給用戶使用。

接下來介紹怎么驗(yàn)證這個(gè)圖譜是合理的。主要是從三個(gè)層面驗(yàn)證。

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第一個(gè)最簡單的就是跨模態(tài)比較(Cross-modality Comparison)。比如說用DTI(磁共振彌散張量成像)技術(shù)定義解剖連接模式得出的結(jié)果,和用功能連接、細(xì)胞構(gòu)筑或其他模態(tài)得出的分區(qū)結(jié)果是否一致?

第二個(gè)層面是從遺傳機(jī)制這個(gè)全新的角度去證明其合理性。

第三個(gè)層面是最重要的,即能否基于連接模式預(yù)測(cè)腦區(qū)的功能在什么地方。比如說進(jìn)行記憶任務(wù)時(shí)會(huì)激活某些區(qū)域,而如果基于解剖連接就能預(yù)測(cè)哪個(gè)地方會(huì)被激活,這就更上一個(gè)層次了。

先從第一個(gè)層面給大家介紹不同模態(tài)之間怎么去驗(yàn)證。

這個(gè)驗(yàn)證的背景在于,腦區(qū)的劃分有基于細(xì)胞構(gòu)筑的,有基于解剖連接的,有基于功能連接的等等。那么,這些不同的劃分方式是否能夠得出一樣的分區(qū)結(jié)果?

如Broca區(qū)(布羅卡皮層區(qū))基于細(xì)胞構(gòu)筑已經(jīng)區(qū)分出了很多腦區(qū),那么再用解剖連接進(jìn)行劃分,得出來的結(jié)果跟基于細(xì)胞構(gòu)筑區(qū)分出的結(jié)構(gòu)是否一樣?

我們發(fā)現(xiàn)結(jié)果非常一致。

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此外,也可以基于連接模式把Wernicke's area(韋尼克區(qū))分成三個(gè)不同的亞區(qū),然后再通過術(shù)中電刺激(Intraoperative Electrical Stimulation)刺激每一個(gè)亞區(qū),看哪些亞區(qū)是跟語言有關(guān)的,或者去看不同亞區(qū)的功能是否一樣。這也是一種驗(yàn)證方式。

除了皮層上面的腦區(qū)可以用跨模態(tài)驗(yàn)證,皮層下的腦區(qū)也可以,如伏隔核(nucleus accumben)。用三種不同的成像模式所獲得的伏隔核的分區(qū)結(jié)果是完全一樣的。

第二個(gè)層面的驗(yàn)證則基于遺傳相關(guān)性。這方面在人和動(dòng)物上已經(jīng)有了一些突破性的進(jìn)展。

2011年,《NEURON》上發(fā)表了一篇文章,里面利用了雙生子進(jìn)行計(jì)算。同卵雙生的遺傳系數(shù)是1,異卵的則為0.5。

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這就是所謂的雙生子模型。

雙生子模型是怎么做的呢?先提取人的皮層,進(jìn)行三角剖分。每一個(gè)三角片都可以算出一個(gè)面積。因?yàn)槿瞧皇堑热瞧写笥行。@樣就可以把每個(gè)頂點(diǎn)作為節(jié)點(diǎn),然后用一個(gè)模型去算遺傳相關(guān)系數(shù)。

所謂遺傳相關(guān)系數(shù),就是以三角形的頂點(diǎn)作為節(jié)點(diǎn)重新劃分皮層,得到一個(gè)遺傳相關(guān)矩陣(Genetic correlation matrix),在這上面去聚類,就可以把不同的亞區(qū)聚在不同的類里面。

這種方式既沒有用到連接模式,也沒有用到細(xì)胞構(gòu)筑,但分區(qū)的結(jié)果跟基于連接模式得出的結(jié)果幾乎是完全一樣的。

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這就說明邊界的形成,即patterning,可能先天就是如此,后天也許會(huì)有一些改變,但那些改變?cè)诖蟪叨壬峡赡苁俏⒉蛔愕赖摹_@是另外一種驗(yàn)證方式。

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第三個(gè)層面,基于連接模式,甚至能夠預(yù)測(cè)人在進(jìn)行某種任務(wù)時(shí)大腦所激活的區(qū)域。

我們不是第一個(gè)提出來的,我們只是想用這個(gè)方式去驗(yàn)證它。

2012年《NAT NEUROSCI》上有一篇文章表示,基于DTI的解剖連接能夠預(yù)測(cè)一些非常簡單的區(qū)域,如面孔識(shí)別的區(qū)域,特別是梭狀回。識(shí)別面孔時(shí),大腦的哪個(gè)區(qū)域會(huì)被激活?如果基于彌散磁共振成像所獲得的解剖連接同樣能夠預(yù)測(cè)到哪個(gè)地方有激活,這就很有意思了。

但更為關(guān)鍵的問題是,現(xiàn)在已經(jīng)能夠預(yù)測(cè)一個(gè)腦區(qū),那么全腦的其他功能區(qū)域能不能預(yù)測(cè)?

第二個(gè)非常關(guān)鍵的問題是,現(xiàn)在只是能夠預(yù)測(cè)一些很簡單的腦區(qū),如動(dòng)手指、識(shí)別面孔等等,那么對(duì)于像工作記憶(workingmemory)這樣的區(qū)域——復(fù)雜且激活的是多個(gè)腦區(qū),能否進(jìn)行預(yù)測(cè)?如果能夠預(yù)測(cè),不同腦區(qū)的預(yù)測(cè)效果是否一樣?

為了解決這個(gè)問題,我們利用了一個(gè)跟機(jī)器學(xué)習(xí)有關(guān)的非常重要的模型。

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研究使用的是美國Human Connectome Project(HCP,人腦連接組計(jì)劃)的數(shù)據(jù),里面提供了七個(gè)不同的任務(wù),有工作記憶、體育、社會(huì)相關(guān)的、語言的等等,每個(gè)任務(wù)都會(huì)導(dǎo)致一些腦區(qū)的激活。

我們列出了兩列數(shù)據(jù),一列是用解剖連接預(yù)測(cè)出來的結(jié)果,一列是真實(shí)的激活組。兩組數(shù)據(jù)一比較,幾乎是一模一樣的。所以第一個(gè)結(jié)論就是,任何一個(gè)任務(wù)都可以用彌散磁共振成像提供的解剖連接的方式進(jìn)行預(yù)測(cè)。

如果能夠預(yù)測(cè)到,預(yù)測(cè)的效果是否一樣?為了判斷這個(gè)問題,我們定義了一種指標(biāo),Connectivity-function Relationship(CFR),用于刻畫預(yù)測(cè)精度。

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CFR這樣一個(gè)量,它在全腦的分布是否一樣?也就是說,兩個(gè)完全不同的腦區(qū),比如說聯(lián)合皮層跟感覺運(yùn)動(dòng)皮層,即一些復(fù)雜的皮層跟簡單一點(diǎn)的皮層相比較,它是一樣?還是不一樣?我們就發(fā)現(xiàn)不同腦區(qū)的CFR實(shí)際上是不一樣的。

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CFR不僅不一樣,還有一個(gè)層級(jí)結(jié)構(gòu),即越簡單的腦區(qū),預(yù)測(cè)的精度就越高。按照從簡單到復(fù)雜的順序,把這七個(gè)任務(wù)相關(guān)的腦網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行排序,可以發(fā)現(xiàn)和視覺、運(yùn)動(dòng)相關(guān)的網(wǎng)絡(luò)的CFR指標(biāo)很高,即預(yù)測(cè)的精度很高。

CFR指標(biāo)會(huì)隨著從簡單到復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),呈現(xiàn)出從高到低,逐步遞減的趨勢(shì)。

而這樣的層級(jí)結(jié)構(gòu),其分布方式跟大腦本身的很多生物學(xué)意義是完全一致的。

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比如Myelin(髓磷脂),就是說髓鞘化功能的靈活性、個(gè)體之間的功能差異,也有這樣一種從簡單到復(fù)雜、CFR指標(biāo)從高往低的排序過程。CFR指標(biāo)跟它有非常好的對(duì)應(yīng)關(guān)系。

大家如果對(duì)這個(gè)問題感興趣,可以看看我們最近剛發(fā)表在《CEREBRAL CORTEX》上的一篇文章。

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下面再講幾個(gè)應(yīng)用的例子。

第一,通過腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜可能會(huì)發(fā)現(xiàn)一些新的腦區(qū)。

第二,與抑郁癥有關(guān)。我們發(fā)現(xiàn)男女在調(diào)節(jié)情緒方面使用的是完全不同的網(wǎng)絡(luò)。

第三,腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜可能會(huì)給疾病的診斷或治療帶來一些全新的觀點(diǎn)。

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第一個(gè)應(yīng)用以旁海馬腦區(qū)(lateral parahippocampal region)為例。

為什么以旁海馬為例呢?主要是因?yàn)檫@個(gè)跟老年癡呆有關(guān)。

像心理疾病、AD(阿爾茲海默癥)這樣的精神類疾病,影像到底能在多大程度上幫助醫(yī)生進(jìn)行診斷?這方面的知識(shí)實(shí)際上非常有限。盡管文章發(fā)了很多,但要應(yīng)用到臨床還是非常困難的。

但旁海馬這個(gè)腦區(qū),包括內(nèi)側(cè)顳葉、腦皮質(zhì)的萎縮可以用于輔助診斷AD。早在2007年,歐盟的指南里就已經(jīng)提到了內(nèi)側(cè)顳葉。旁海馬實(shí)際上只是內(nèi)側(cè)顳葉的一小部分。

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以前的傳統(tǒng)是將旁海馬分成前層跟后層。基于前層旁海馬和后層旁海馬,又提出了一個(gè)所謂的記憶系統(tǒng)。跟前層旁海馬相連的那些腦區(qū)所構(gòu)成的網(wǎng)絡(luò)叫前記憶系統(tǒng);跟后層旁海馬相連的那些腦區(qū)所構(gòu)成的網(wǎng)絡(luò)就叫后記憶系統(tǒng)。

關(guān)于模型的提出發(fā)表在《Nat Rev Neurosci》上。這個(gè)模型出來以后,很多研究都想借助它解釋一些跟情緒相關(guān)的現(xiàn)象,但實(shí)際上沒辦法解釋。所以這樣就提出了非常嚴(yán)格的條件。

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而用腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜的思想對(duì)旁海馬重新分區(qū)以后,發(fā)現(xiàn)旁海馬不僅有前后兩個(gè)分區(qū),而是至少可以分成前、中、后三個(gè)分區(qū)。

經(jīng)過反復(fù)的驗(yàn)證,從功能連接,到跟海馬從前到后的連接強(qiáng)度、跟內(nèi)嗅皮層從前到后的連接強(qiáng)度等等,發(fā)現(xiàn)這三個(gè)腦區(qū)的模式是完全不同的,這就證明了旁海馬有三個(gè)分區(qū)。

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分出三個(gè)分區(qū)的意義就在于,以前的模型要重新改寫,包括旁海馬的連接圖譜都要發(fā)生變化,以前的圖譜就不能再用了。

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更重要的是,我們發(fā)現(xiàn)AD病人的旁海馬經(jīng)歷了前、中、后這樣一個(gè)漸變的過程。在較早的時(shí)候,可能只有最前層開始萎縮,慢慢地往中間的過渡,等老年癡呆以后,整個(gè)旁海馬都開始萎縮了。

所以,使用腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜的話,可能可以在很早的時(shí)候就發(fā)現(xiàn)這些蛛絲馬跡,而不是等到造成了災(zāi)難性的后果以后才能知道。

這個(gè)例子就說明,基于腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜可以去發(fā)現(xiàn)一些從前沒有發(fā)現(xiàn)的腦區(qū),并且能夠給出一個(gè)非常清楚的解釋。

下面再講一下第二個(gè)應(yīng)用的例子。

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現(xiàn)在抑郁癥病人中,女性要比男性多很多。這是流行病學(xué)調(diào)查的數(shù)據(jù),誰也不能解釋為什么是這樣的。另一方面,情緒調(diào)節(jié)是抑郁癥最核心的一個(gè)癥狀。

那么我們就要問,哪些腦區(qū)或者一個(gè)什么樣的腦網(wǎng)絡(luò)是支撐情緒調(diào)節(jié)的?

這個(gè)問題到現(xiàn)在并沒有非常清晰的答案。但有一些腦區(qū)跟情緒調(diào)節(jié)有關(guān)是非常明確的。像Amygdala,即杏仁核腦區(qū),就是跟情緒調(diào)節(jié)有關(guān)的,而且這個(gè)結(jié)論非常明確。

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那么就以杏仁核為出發(fā)點(diǎn),計(jì)算它跟全腦的連接強(qiáng)度,然后再按照連接強(qiáng)度跟情緒調(diào)節(jié)的分?jǐn)?shù)之間的相關(guān)性,看女性和男性之間是否存在差別。

我們發(fā)現(xiàn),如果用傳統(tǒng)的圖譜,即把整個(gè)杏仁核作為一個(gè)腦區(qū)進(jìn)行分析,兩者是沒有差別的。

那么再往前走一步,用新的圖譜把杏仁核分成三個(gè)不同亞區(qū),即centromedial nuclei group(CM)、laterobasal nuclei group(LB)跟the superficial nuclei group(SF)。

在這三個(gè)亞區(qū)上重復(fù)剛才的過程,即計(jì)算這三個(gè)亞區(qū)跟全腦的連接強(qiáng)度,再去跟情緒調(diào)節(jié)的分?jǐn)?shù)做相關(guān)性分析,看女性和男性之間到底有沒有本質(zhì)的區(qū)別。

我們招募了三百多個(gè)大學(xué)生進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)很有意思的現(xiàn)象。

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央內(nèi)側(cè)核(CM of Amygdala)和額上回(superior frontal gyrus)的連接強(qiáng)度,跟情緒調(diào)節(jié)的分?jǐn)?shù)做相關(guān)性分析以后,在男性里面呈現(xiàn)正相關(guān),女性里面則呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)。

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但同樣是中央內(nèi)側(cè)核,它跟島葉(insula)或顳上回(superior temporal gyrus)這樣一些腦區(qū)的連接強(qiáng)度,跟情緒調(diào)節(jié)的分?jǐn)?shù)做相關(guān)以后,男性里面又變成了負(fù)相關(guān),女性里面則變成了正相關(guān)。

這也就說明,男性和女性使用了兩個(gè)完全不同的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行情緒調(diào)節(jié)。這是非常有意思的一個(gè)證據(jù)。

這個(gè)例子也說明,如果仍然使用老圖譜,也許什么有意思的結(jié)果都發(fā)現(xiàn)不了。但如果使用新的圖譜,就會(huì)發(fā)現(xiàn)類似這樣一個(gè)非常有意思的現(xiàn)象。而以前基于老圖譜得出的很多結(jié)論有可能要重寫。

再講一個(gè)和診斷有關(guān)的例子。

大家都知道,現(xiàn)在精神類疾病沒有定量的生物標(biāo)志,基本都是靠醫(yī)生的經(jīng)驗(yàn)對(duì)病人進(jìn)行問癥分析,進(jìn)而做出診斷。

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而我們通過腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,提取紋狀體進(jìn)行分析,定義了一個(gè)紋狀體功能異常(Functional Striatal Abnormality, FSA)的定量指標(biāo)。

我們基于973項(xiàng)目采集了五年所得到的數(shù)據(jù),包含了千余例精神分裂癥患者與正常對(duì)照的多模態(tài)影像學(xué)數(shù)據(jù)。其中,有七家醫(yī)院,每家醫(yī)院都有大概中等規(guī)模的樣本。而紋狀體功能異常能夠在另外的至少七家醫(yī)院里面非常好地重復(fù)。

可重復(fù)性是能不能形成生物標(biāo)志的最關(guān)鍵的因素。比如說,你發(fā)現(xiàn)了一個(gè)精神分裂癥患者與正常對(duì)照異常的指標(biāo),但是無法在不同機(jī)型的機(jī)器上得到重復(fù)性的結(jié)果,那么這個(gè)指標(biāo)就是無效的。

現(xiàn)在發(fā)表的大部分研究成果都是在單中心上做出來的,但這個(gè)中心得出的結(jié)果,在另外一個(gè)中心卻未必能夠重復(fù)。

所以我們第一步就發(fā)現(xiàn)這七個(gè)中心都能很好地重復(fù)紋狀體功能異常這個(gè)指標(biāo)。

接著,基于這個(gè)指標(biāo),可以回過頭來,利用深度學(xué)習(xí)等其他知識(shí)去做分類,發(fā)現(xiàn)它是一個(gè)能夠很好地將精神分裂癥和正常人區(qū)分開的生物標(biāo)志。

病人服用現(xiàn)在常用的藥物進(jìn)行治療以后,其生物標(biāo)志的異常是否減輕?或者一個(gè)藥物療程以后,病人的癥狀有明顯的改善,這時(shí)的指標(biāo)是否也已經(jīng)往正常水平靠攏?答案是肯定的。

這個(gè)例子就說明,可以基于腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,去尋找一些疾病診斷的生物標(biāo)志。

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再講一個(gè)跟治療有關(guān)的例子。

現(xiàn)有的證據(jù)證明,對(duì)帕金森這類神經(jīng)退行性的疾病來說,藥物治療的意義其實(shí)不是特別大。但現(xiàn)在有其他的治療方式,像DBS(Deep Brain Stimulation)就明顯比藥物治療的效果要好。但DBS治療也有副作用,它會(huì)導(dǎo)致抑郁、自殺等等。

DBS治療的靶點(diǎn)主要在丘腦底核(subthalamus nucleus ,STN)。而丘腦底核可以分成三個(gè)不同亞區(qū),分別跟運(yùn)動(dòng)、情緒、社會(huì)認(rèn)知功能有關(guān)。如果電極剛好放在跟運(yùn)動(dòng)有關(guān)的腦區(qū),那么治療效果可能就很好。

但是如果放偏了,放在了跟情緒有關(guān)的腦區(qū)——本來帕金森不是情緒障礙,這就等于是來回刺激一個(gè)正常的腦組織,就會(huì)從正常變成異常,從而導(dǎo)致抑郁、自殺;當(dāng)電極放偏到跟社會(huì)認(rèn)知功能有關(guān)的地方,可能就會(huì)導(dǎo)致社會(huì)認(rèn)知功能障礙。

本來有了腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜以后,以前的那些問題都不是問題了,但就是因?yàn)殡姌O放錯(cuò)了位置,反而導(dǎo)致了新的問題。

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所以要如何解決這個(gè)電極放置的問題?首先,醫(yī)生要利用腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜找到合適的位置。但光有圖譜,有經(jīng)驗(yàn)的醫(yī)生可能可以一放一個(gè)準(zhǔn),新醫(yī)生卻未必能放準(zhǔn)。

所以我們希望能夠建造一個(gè)手術(shù)機(jī)器人,手術(shù)規(guī)劃好以后由機(jī)器人去放置電極。為此,我們提出了一個(gè)新名詞——腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜導(dǎo)航的手術(shù)機(jī)器人(Brainnetome Atlas Guided Neurosurgical Robot)。第一款機(jī)器人馬上就要出來了。

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簡單地總結(jié)一下。

今天介紹了一個(gè)新的圖譜——腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,是用跟以前完全不一樣的基于解剖連接的信息構(gòu)造的。

接著介紹了腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜的作用,并通過不同的方式證明它是合理的。腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜可以用于發(fā)現(xiàn)新的腦區(qū),也可以用來尋找疾病診斷的生物標(biāo)志,還可以提供神經(jīng)調(diào)控的精準(zhǔn)靶點(diǎn)等等。

腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜不僅僅是一個(gè)圖譜,而是開辟了一個(gè)新的領(lǐng)域。

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現(xiàn)在研究的方向分為“一體兩翼”。

“一體”就是腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜本身。比如說,我們現(xiàn)在只是構(gòu)建了一個(gè)人類腦圖譜,那么能不能把圖譜個(gè)體化?有沒有一種方式能夠?qū)⒚總€(gè)病人的圖譜快速地繪制出來?包括整個(gè)老化過程、發(fā)育過程對(duì)圖譜是怎么影響的等等。

更重要的是每一個(gè)腦區(qū)的功能是什么?像情緒記憶等等有哪些腦區(qū)參與了?這里面實(shí)際上有很多東西可以研究。這個(gè)就叫“一體”,就是關(guān)注圖譜。

除了腦圖譜本身的研究以外,還有“兩翼”,即兩個(gè)應(yīng)用。

一個(gè)是跟“類腦”有關(guān),也就是所謂的環(huán)路特異性的腦機(jī)交互,或者腦機(jī)融合。

另一個(gè)就是疾病的診療。前面已經(jīng)舉了兩個(gè)例子,就已經(jīng)不言自喻。引入新的圖譜以后,可能很多結(jié)論都會(huì)發(fā)生變化。大數(shù)據(jù),加上腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,再加上人工智能的一些新方法,可能會(huì)讓現(xiàn)在腦疾病面臨的一些瓶頸問題取得突破。

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除了繪制人的腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,還可以繪制獼猴的腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜。因?yàn)楂J猴的腦袋跟人腦比較相似,所以獼猴是研究人類很多疾病所必須的一個(gè)模型。

更重要的是,我們不僅可以建立宏觀尺度的腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,還可以在獼猴上建立介觀尺度的圖譜。

所謂建立介觀尺度的腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜,就是在宏觀尺度的基礎(chǔ)上,利用其他技術(shù),把細(xì)胞尺度上面的不同連接統(tǒng)統(tǒng)構(gòu)建出來。

未來我們也有一些國際合作項(xiàng)目。比如跟于利希中心有一個(gè)國際合作重點(diǎn)項(xiàng)目,主要是想把細(xì)胞構(gòu)筑的分區(qū)跟基于連接模式進(jìn)行分區(qū)的兩個(gè)結(jié)果放在一起進(jìn)行比較。

腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜研究項(xiàng)目是中國科學(xué)院國家自然科學(xué)基金委員會(huì)的重大研究計(jì)劃,獲得了科技部973項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金委以及中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)的資助。

謝謝大家,我的報(bào)告到此結(jié)束。

原文標(biāo)題:萬字長文 | 中科院蔣田仔教授:腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜及其在腦認(rèn)知與腦疾病方面的應(yīng)用

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    的頭像 發(fā)表于 01-25 14:55 ?1553次閱讀
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