由合成DNA構成的生物電路有著極其廣泛和重要的醫學應用。盡管這項技術還處于早期階段,但這種方法已經被用于制造診斷癌癥和識別內傷的測試,如創傷性腦損傷、失血性休克等。此外,合成的生物回路可以用來精確地將藥物輸送到細胞中,并根據需要提供特定的劑量。
生物回路的可能應用數量是巨大的,為它們確定適當的化學反應所需的計算也是如此。但由于新改進的軟件程序,現在設計這些電路將更容易。最近發表在IEEE Design & Test上的一項研究對這一進展進行了描述。
南馬托格羅索聯邦大學(Universida de Federal de Mato Grosso do Sul,UFMS)計算機系兼職教授Renan Marks參與了這項研究。他的團隊最初創建了一個名為DNAr的軟件程序,研究人員可以用它來模擬各種化學反應,然后設計新的生物電路。在他們最近的工作中,他們為這個程序開發了一個軟件擴展,稱為DNAr-Logic,它允許科學家在高層次上描述他們想要的電路。該軟件對邏輯電路進行高級描述,并將其轉換為可以在DNA鏈中合成的化學反應網絡。
Marks表示,他的團隊的新軟件擴展的一個優點是,它將使科學家們更加專注于電路的設計,而不是擔心化學連鎖反應的計算和細節。他們可以使用DNAr-Logic來設計和模擬(生物電路),而無需事先掌握化學知識,也無需手工編寫模擬其動態行為所需的數百個反應和微分方程 —— 該軟件將化學反應細節的負擔從科學家的肩上卸了下來。
他的團隊在一系列模擬中測試了新軟件。“結果表明,邏輯電路可以完美地設計、模擬和測試,”Marks表示,并指出了他們能夠使用DNAr-Logic設計出一些能夠產生多達600種不同反應的合成生物電路。
然而,在醫學應用中充分實現這一技術仍然存在許多障礙。一個懸而未決的問題是,由松散的DNA鏈組成的生物回路可能會發生“泄漏反應”。這是指某些DNA鏈可能無意中與溶液中的其他DNA鏈發生反應,從而導致錯誤的“計算”。Marks承認,“盡管泄漏反應等問題仍需解決,合成生物電路有著巨大的潛力。這一新的研究領域開啟了無限的可能性,”他說。
同時,Marks還表示;“今后,我計劃繼續開發新的擴展,以擴展DNAr軟件的新功能,其他研究人員可以依賴這些新功能。此外,我還計劃使用DNAr作為一個框架,協助研究和開發基于算法的新電路,以幫助衛生專業人員更快地診斷疾病,并在衛生治療中更有效。”
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原文標題:基于DNA的電路可能是醫學的未來 應用程序或幫助我們更快到達?
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