在經(jīng)過(guò)近二十年的發(fā)展,數(shù)字微流控技術(shù)逐漸成熟,理論也逐漸完善,近幾年國(guó)內(nèi)外涌現(xiàn)出諸多商品化產(chǎn)品,將數(shù)字微流控技術(shù)推向市場(chǎng)。盡管數(shù)字微流控技術(shù)逐漸成熟,但該技術(shù)仍存在加工成本高、技術(shù)要求高、儀器開發(fā)難度大等諸多問(wèn)題待解決,這也大大限制了該技術(shù)的普及。
目前仍然有許多科研工作者致力于解決這些問(wèn)題,帶領(lǐng)數(shù)字微流控技術(shù)走出實(shí)驗(yàn)室,走進(jìn)人們的日常生活,實(shí)現(xiàn)在即時(shí)檢測(cè)、食品安全、環(huán)境監(jiān)測(cè)、生化分析等領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用。
1、ePlex平臺(tái)
ePlex是美國(guó)GenMark公司研發(fā)的一種數(shù)字微流控平臺(tái),它具備高度的自動(dòng)化特性,是目前市場(chǎng)上唯一一個(gè)從采樣到應(yīng)答的工作流系統(tǒng)。ePlex秉承著為患者設(shè)計(jì),為實(shí)驗(yàn)室優(yōu)化的理念,經(jīng)過(guò)精心設(shè)計(jì),實(shí)現(xiàn)了高度的自動(dòng)化和集成化。
ePlex根據(jù)實(shí)驗(yàn)室和醫(yī)療系統(tǒng)的多樣化和不斷變化的需求,結(jié)合客戶反饋、自由定制和直觀的用戶界面,旨在開發(fā)一種更為高效和人性化的軟件。為滿足大多數(shù)機(jī)構(gòu)的需求,ePlex系統(tǒng)提供了模塊化和可伸縮的設(shè)計(jì),通過(guò)一個(gè)簡(jiǎn)化的路徑增加容量。
目前ePlex擁有5種不同的儀器配置,測(cè)試通道最多可達(dá)到24個(gè),其中ePlex NP每次可同時(shí)測(cè)試12個(gè)患者樣本,而ePlex4的配置超過(guò)了世界上任何一個(gè)從采樣到應(yīng)答平臺(tái)。
到目前為止,ePlex一共更新過(guò)4次,每個(gè)版本都做出了重大的改進(jìn)并引入了更多的增強(qiáng)功能,旨在提高每一個(gè)環(huán)節(jié)的效率。
ePlex4提供了許多新功能,有助于提高以患者為中心的醫(yī)療服務(wù)效率,其具備24個(gè)通道,每天可檢測(cè)288個(gè)患者樣本,可自動(dòng)進(jìn)行質(zhì)量監(jiān)控,檢測(cè)速度較ePlex1提高了4倍。
GenMark公司主要有呼吸道病毒檢測(cè)芯片、HCVg直接檢測(cè)、囊性纖維化基因分型、血栓形成傾向風(fēng)險(xiǎn)測(cè)試、華法林阻凝劑敏感性測(cè)試等。
其中,GenMark eSensor技術(shù)是基于競(jìng)爭(zhēng)DNA雜交和電化學(xué)檢測(cè)原理。其對(duì)目標(biāo)生物標(biāo)志物具有很高的特異性,并不基于熒光或光學(xué)檢測(cè)。因此,診斷測(cè)試不太容易出現(xiàn)樣本污染風(fēng)險(xiǎn),也不需要耗時(shí)的清洗和準(zhǔn)備步驟。
2、OpenDrop平臺(tái)
OpenDrop是由一個(gè)開放研究團(tuán)隊(duì)Gaudi團(tuán)隊(duì)研發(fā)的數(shù)字微流控平臺(tái),首次在2017年微流控年會(huì)上展示。該平臺(tái)利用介電潤(rùn)濕的原理控制微小液滴的運(yùn)動(dòng),在芯片上實(shí)現(xiàn)小體積反應(yīng),可應(yīng)用于芯片實(shí)驗(yàn)室中的數(shù)字生物自動(dòng)化過(guò)程。同樣作為一種開放性的平臺(tái),OpenDrop支持操作硬件所需的所有設(shè)計(jì)文件和軟件都在開放許可下共享。
為了降低其他實(shí)驗(yàn)室對(duì)數(shù)字微流控的研究門檻和成本,該團(tuán)隊(duì)秉持著DIY模式和低成本的理念,盡可能使用市場(chǎng)上標(biāo)準(zhǔn)化組件、材料和生產(chǎn)過(guò)程,將設(shè)備運(yùn)行的成本最小化,以避免個(gè)別客戶無(wú)法使用部件或需要支付昂貴的安裝費(fèi)用。
Gaudi團(tuán)隊(duì)最早是從印刷電路板上的電潤(rùn)濕實(shí)驗(yàn)開始研究數(shù)字微流控平臺(tái),通過(guò)Arduino UNO控制晶體管對(duì)電極供電。經(jīng)過(guò)短短兩三年的時(shí)間,Gaudi團(tuán)隊(duì)已經(jīng)在數(shù)字微流控儀器構(gòu)建上取得了重大進(jìn)展。到目前為止,OpenDrop平臺(tái)已經(jīng)更新到第四代。
第一代是以印刷電路板作為電極層,通過(guò)可伸縮的電子控制和簡(jiǎn)單的涂布方法,實(shí)現(xiàn)了DIY模式和低成本理念。
第二代采用兩倍電壓驅(qū)動(dòng)芯片HV507,并擴(kuò)大了電極陣列,從原來(lái)的8×8電極陣列擴(kuò)大到16×8電極陣列,每個(gè)電極2.75mm。此外還增加了液體進(jìn)樣口、LED顯示屏、電壓控制讀取模塊以及wifi模式。
第三代是OpenDrop V3,相比于前兩代,第三代OpenDrop做出了重大的改進(jìn),具有許多新的特性。首先在電極方面,OpenDrop V3采用鍍金的電極陣列,將14x8電極陣列和4個(gè)儲(chǔ)液槽集成到印刷電路板上,液滴可以停留在涂覆了疏水材料的薄膜上;在液滴驅(qū)動(dòng)方面,該設(shè)備通過(guò)USB-C到USB-A電纜供電,運(yùn)用軟件設(shè)置驅(qū)動(dòng)電壓,可高達(dá)300V,支持交流和直流電壓兩種模式;OpenDrop V3運(yùn)用32位AVR SAMD21G18微處理器,擁有充足的內(nèi)存和電源;增加了多音音頻放大器和揚(yáng)聲器。
OpenDrop V4是OpenDrop平臺(tái)的最新版本,在第三代的基礎(chǔ)上,芯片卡盒做了較大的改進(jìn)。主機(jī)上設(shè)置有卡槽,將組裝好的芯片卡盒嵌入進(jìn)開放式或“無(wú)頂式”電潤(rùn)濕儀器中,即可開展設(shè)備演示,更適用于研討會(huì),教學(xué)和技術(shù)演示。
利用介電潤(rùn)濕效應(yīng)來(lái)移動(dòng)液滴的關(guān)鍵是擁有一個(gè)超疏水性良好的滑動(dòng)表面,市場(chǎng)上有不同的電潤(rùn)濕涂層材料,如氟化聚合物、特氟龍等,這些都是非晶型氟聚物,可通過(guò)自旋涂層或浸漬涂層沉積。
Gaudi團(tuán)隊(duì)最早只是使用了聚乙烯(polyethylene, PE)和廚房錫紙材料作為疏水材料,再在上面涂布Rain-X—一種用于擋風(fēng)玻璃的商用防雨劑。后來(lái)他們發(fā)現(xiàn)在簡(jiǎn)單的無(wú)上極板體系中利用保鮮膜和硅油組合作為疏水層是一個(gè)更好的選擇。之后為了適應(yīng)有上極板的體系,他們開發(fā)了更先進(jìn)的解決方案,即使用聚四氟乙烯箔和氟化聚合物作為疏水材料。
3、DBS數(shù)字微流控平臺(tái)
2010年成立的上海衡芯生物科技有限公司(簡(jiǎn)稱“衡芯生物”),是我國(guó)家專注于開發(fā)數(shù)字微流控芯片、儀器及其應(yīng)用的高新生物科技公司,在數(shù)字化微流控技術(shù)方面已經(jīng)獲得多項(xiàng)國(guó)際專利。自成立起至2013年,該公司依次完成了以硅為基底的微流控芯片和玻璃芯片的研發(fā),并于2014年在中國(guó)、美國(guó)、歐盟、韓國(guó)等多個(gè)國(guó)家或地區(qū)獲得雙電極結(jié)構(gòu)芯片的授權(quán)。2015年,衡芯生物完成了與羅氏診斷的合作,實(shí)現(xiàn)了衡芯產(chǎn)品在手足口病、肺結(jié)核、乙肝等傳染病檢測(cè)中的應(yīng)用。
該公司針對(duì)不同實(shí)驗(yàn)的需求對(duì)芯片進(jìn)行不同的設(shè)計(jì),為方便控制溫度及光學(xué)測(cè)量,他們采用玻璃基底和透明電極;為實(shí)現(xiàn)微量樣品的檢測(cè),他們?cè)O(shè)計(jì)的上板有玻璃和塑料兩種形式,并且設(shè)有進(jìn)樣和取樣孔。目前,衡芯生物生產(chǎn)的數(shù)字微流控設(shè)備主要有以下三種。
(1)基于數(shù)字微流控技術(shù)的定量PCR(polymerase chain reaction, 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))儀一DBS-qPCR HT。作為一種高靈敏度的分子檢測(cè)方法,定量PCR在生命科學(xué)研究、臨床醫(yī)療檢測(cè)等領(lǐng)域廣泛應(yīng)用,包括傳染病的診斷與療效評(píng)估,腫瘤標(biāo)志物及其基因檢測(cè),優(yōu)生優(yōu)育檢測(cè),遺傳基因檢測(cè),食品過(guò)敏源、轉(zhuǎn)基因檢測(cè),動(dòng)物疾病檢測(cè),法醫(yī)鑒定,衛(wèi)生檢驗(yàn)檢疫等。
他們?cè)谛酒牟煌瑓^(qū)域設(shè)置PCR所需溫度,通過(guò)移動(dòng)液滴的方法對(duì)其進(jìn)行PCR,并可實(shí)現(xiàn)16個(gè)樣本同時(shí)熒光檢測(cè)。DBS-qPCR HT的反應(yīng)體積范圍大,在2~15uL,可用于體積要求較大的傳染病樣本檢測(cè),又可用于對(duì)試劑成本較高或起始量較小的樣本檢測(cè),在小體積時(shí)最快在15min之內(nèi)可完成40個(gè)PCR循環(huán),具備高速、高效的特點(diǎn)。
(2)基于數(shù)字微流控技術(shù)的高通量測(cè)序自動(dòng)建庫(kù)儀—DBS-LibPrep,這是個(gè)適用于Illumina測(cè)序平臺(tái)的文庫(kù)制備系統(tǒng),用戶只需完成加樣和加試劑的操作剩下的諸如酶切、末端修復(fù)、加腺嘌吟核苷酸尾、加連接頭、PCR以及磁珠清洗等過(guò)程均可由儀器自動(dòng)完成。相比于傳統(tǒng)的建庫(kù)方法,DBS-LibPrep最多可節(jié)省95%的試劑用量。它操作簡(jiǎn)便,只需要一次性加樣和一鍵操作,即可同時(shí)實(shí)現(xiàn)4個(gè)文庫(kù)的制備,制備好的文庫(kù)可直接用于上機(jī)測(cè)序。
(3)基于數(shù)字微流控技術(shù)的熒光定量PCR儀一DBS-3000mini,是上海衡芯生物科技有限公司專門為基于液體工作站文庫(kù)構(gòu)建而設(shè)計(jì)的,集DNA擴(kuò)增和定量于一體。DBS-3000mini有16個(gè)獨(dú)立控制的反應(yīng)通道,在擴(kuò)增DNA的同時(shí)對(duì)樣本的熒光強(qiáng)度進(jìn)行實(shí)時(shí)測(cè)量,當(dāng)樣本的熒光強(qiáng)度達(dá)到閾值時(shí),可以停止對(duì)該樣本的溫度循環(huán),而其他樣本的擴(kuò)增可以繼續(xù)進(jìn)行。
這樣不管起始濃度差,建庫(kù)結(jié)束后16個(gè)樣本的濃度量級(jí)相當(dāng),保證了擴(kuò)增后16個(gè)樣本的均一性,從而提高了測(cè)序的質(zhì)量。這臺(tái)儀器可單獨(dú)作為定量PCR儀或液體工作站的插件使用,在二代測(cè)序樣本建庫(kù)時(shí),可對(duì)每個(gè)樣本進(jìn)行獨(dú)立的PCR熒光監(jiān)測(cè)與控制。
另外,該公司可提供數(shù)字微流控產(chǎn)品定制,自由選擇功能模塊,包括1~5個(gè)芯片溫控模塊(4~100℃),對(duì)芯片實(shí)現(xiàn)區(qū)域控溫、1~4個(gè)波長(zhǎng)光激發(fā),在芯片上可同時(shí)對(duì)16個(gè)液滴進(jìn)行光激發(fā)和檢測(cè)、芯片上的磁珠控制,用于對(duì)DNA或抗原的捕獲、清洗和洗脫??蓪?shí)現(xiàn)多種功能:①極速實(shí)時(shí)熒光定量PCR;②高通量恒溫?zé)晒舛繖z測(cè);③核酸樣本預(yù)處理;④免疫熒光檢測(cè);⑤化學(xué)發(fā)光檢測(cè);⑥細(xì)胞分選;⑦基于CRISPR的核酸檢測(cè)。
4、Digifludic平臺(tái)
迪奇孚瑞生物科技有限公司成立于2018年,主要以數(shù)字微流控技術(shù)為核心,以自動(dòng)化核酸分析系統(tǒng)為主要產(chǎn)品,致力于開發(fā)精準(zhǔn)自動(dòng)化體外診斷設(shè)備,應(yīng)用領(lǐng)域包括醫(yī)療疾病診斷、動(dòng)植物病害檢測(cè)、健康指標(biāo)檢測(cè)、進(jìn)出口檢驗(yàn)檢疫、食品安全檢測(cè)等。該公司應(yīng)用的微流控技術(shù)來(lái)源于澳門大學(xué)的研究成果,在微型芯片上的液滴可以作為載體,承載各種化學(xué)生物反應(yīng)試劑、細(xì)胞、蛋白質(zhì)、DNA和RNA等,使其可以被移動(dòng)、分樣、融合和控溫,繼而能夠自動(dòng)完成各種相關(guān)的測(cè)試反應(yīng)。
迪奇孚瑞生物科技有限公司主要的芯片有傳染病檢測(cè)芯片、健康指標(biāo)檢測(cè)芯片、動(dòng)植物病害檢測(cè)芯片,以及蝦類水產(chǎn)病毒病害檢測(cè)芯片。這里主要介紹傳染病檢測(cè)芯片和動(dòng)植物病害檢測(cè)芯片。
這兩種芯片的外觀基本一致,并且同時(shí)都可以為12個(gè)指標(biāo)進(jìn)行聯(lián)合測(cè)試,一次可加樣多個(gè)指標(biāo)。傳統(tǒng)的PCR流程在實(shí)際的操作中,需要進(jìn)行樣品制備、核酸提取、純化、擴(kuò)增、與標(biāo)志物雜交等步驟,最后才能進(jìn)行檢測(cè),這個(gè)過(guò)程耗時(shí)長(zhǎng)、易污染、對(duì)操作人員和場(chǎng)地有較高的要求。而他們的芯片具有小型化、集成化、自動(dòng)化的特點(diǎn),一次可加樣預(yù)存多個(gè)指標(biāo),在很大程度上解決了上述問(wèn)題,省時(shí)省力,降低污染。
針對(duì)傳染病患者,他們可將多達(dá)12種的致病病原體試劑預(yù)存在芯片上,可一次檢測(cè)出具體是哪種病原體致病,從而讓患者接受更有針對(duì)性的治療。這一過(guò)程耗時(shí)短,可以避免因未及時(shí)治療而導(dǎo)致的病情惡化,也為患者提供便利,在家中便可以檢測(cè)。而對(duì)于養(yǎng)殖業(yè)和農(nóng)業(yè)業(yè)主十分友好,檢測(cè)時(shí)間只需30~60min,方便業(yè)主實(shí)時(shí)掌握質(zhì)量數(shù)據(jù)。
審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:商業(yè)化數(shù)字微流控儀器:ePlex、OpenDrop、DBS、Digifludic
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