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以智能算力助推AI制藥 阿里云全球AI生物智藥大賽火熱進行中

算法與數據結構 ? 來源:算法與數據結構 ? 作者:算法與數據結構 ? 2022-11-17 09:42 ? 次閱讀

醫藥行業有個“雙十定律”—— 一種新藥的誕生,至少需要投入十年時間和十億美金。近年來,制藥成本更是大幅提升,而收益卻持續走低。

在此背景之下,AI開始逐步參與到從藥物靶點發現到臨床試驗的藥物研發全流程中。

行業發展駛入快車道亟需算力支撐

AI制藥通過高通量試錯提高了藥物設計和篩選的成功率,優化流程并降低人力成本,大幅縮短了研發時間,提高研發成功率,被視為醫藥研發的突破口,也成為了資本競相逐鹿的風口。

在2017-2021年間,創新藥領域的AI制藥企業融資事件達199起,融資金額合計近百億美元,在2022年上半年也有45起,累計融資金額達17.6億美元。

另一方面,《以臨床價值為導向的抗腫瘤藥物臨床研發指導原則》、《關于促進人工智能和實體經濟深度融合的指導意見》等一波利好政策的相繼出臺,進一步推動了AI制藥產業變革和加速發展。

但目前AI制藥仍存在數據量不足、數據質量參差不齊、算法精度不高、算法無法滿足需求、算力不夠等諸多障礙,亟需數據、算法、算力方面的提升和突破。

其中最關鍵的算力問題,很大程度上制約了AI制藥的快速發展。比如計算機輔助藥物設計,無論是靶點發現、化合物合成等藥物發現階段,還是化合物篩選等臨床前研究階段,都需要強大的算力作為支撐。

為了尋求算力的支撐和突破,很多新藥研發和AI制藥企業都不約而同地將目光轉向了“上云”。

云計算AI技術 成破局關鍵

日前,深勢科技的新一代藥物計算設計平臺Hermite正式發布,為藥物研發工作者提供CADD中數據、算法、算力三位一體的一站式解決方案。

因為對算力的需求十分明確,深勢科技一開始就選擇了在云上構建業務,采用阿里云彈性高性能計算E-HPC集群為客戶快速部署業務,利用云的彈性伸縮能力最大化利用計算資源,以最高的性價比完成有效的計算。

通過Hermite平臺和阿里云彈性高性能計算E-HPC集群,深勢科技平均每條管線的合成規模由上千縮小到數十,降低了合成成本,減少了定制合成的等待時間,管線推進到臨床前候選化合物的時間也縮短了一半。

無獨有偶,專注于基因檢測和精準醫療的生命醫學企業圣庭醫療也通過上云優化了傳統IDC集群的數據可靠性、運維成本及效率問題,基因比對與分析效率提升了70%。

近年來,圣庭醫療業務量增長快速,服務器與運維成本急速上升,IDC數據中心已跟不上企業的發展速度和需求。阿里云在彈性高性能計算E-HPC集群上實現Slurm業務工作流dependency與自動伸縮的結合,為圣庭醫療有效提升了計算效率,降低了使用成本。

今年5月,晶泰科技的智能化自動藥物發現平臺借助阿里云的醫療AI,讓正大天晴高難度抗腫瘤新藥項目的時間比原計劃縮減了50%。晶泰科技首席科學官張佩宇指出,AI制藥可以助力提高試錯探索的速度并降低成本,為藥企的創新轉型與降本增效提供強大助力。

日前,阿里云還推出了全棧智能計算解決方案“飛天智算平臺”,可將計算資源利用率提高3倍以上,AI訓練效率提升11倍,推理效率提升6倍。深勢科技采用了飛天智算平臺之后,已將集群性能優化提升超過100%,讓分子動力學仿真模擬訓練效率提升了5倍。

在云廠商瞄準這一快速增長的賽道外,眾多軟硬件公司也紛紛發力。為了加速藥物研發中的計算和AI應用,NVIDIA 推出了NVIDIA Clara Discovery平臺,該平臺集GPU 加速及優化的框架、工具、應用和預訓練模型于一體,專為支持跨學科工作流而構建,可幫助科學家和研究人員更快地將藥物投放市場,并為疾病機制研究提供新的可能性。

在9 月份的GTC大會上,NVIDIA推出了 BioNemo,這是一款基于 NVIDIA NeMo Megatron 構建的應用框架和云服務,用于在超級計算規模下訓練和部署大型生物分子 Transformer AI 模型,為蛋白質、DNA 和簡化分子線性輸入規范 (SMILES) 的語言而設計,進一步加速了AI在制藥和生命科學領域的應用。

不難發現,在云計算與AI技術的加持之下,生物制藥產業的效率獲得了極大提升,AI輔助廣譜抗體藥的設計,也已成為業界公認的圣杯。

全球AI生物智藥大賽 助推行業高質量發展

為進一步推動云計算、AI與生物制藥、生命科學領域的交融與發展,為人類更好的生活和生命質量迎難而上,持續發掘行業優秀人才和團隊,阿里云天池大賽與NVIDIA和角井科技共同發起了“云上進化”的2022全球AI生物智藥大賽。

比賽分為“基于AI算法的SARS-CoV-2廣譜中和抗體藥物設計”和“抗原抗體結合Epitope和Paratope精準確定”兩個賽道。本次大賽邀請到了哈佛大學統計系終身教授、清華大學統計研究中心創始人、角井科技創始人劉軍,中國工程院院士、北京大學博雅講席教授、北京大學國際癌癥研究院院長、北京大學健康醫療大數據國家研究院院長詹啟敏,中國科學院院士、上海市免疫治療創新研究院創始院長、上海交通大學醫學院教授董晨,清華大學人工智能研究院常務副院長、歐洲科學院外籍院士孫茂松和浙江大學醫藥學部副主任、浙江大學智能創新藥物研究院副院長何俏軍, NVIDIA中國醫療行業應用總監冀永楠等多位重量級專家作為大賽顧問,為參賽選手們答疑解惑。

目前,全球6000余支參賽隊伍,經過激烈的角逐,遴選出了30支隊伍進入復賽,在復賽階段,大賽專家團隊將和選手一起攜手,借助云上算力,為新冠病毒廣譜中和抗體藥物設計的科研進程加速。

通過此次阿里云2022全球AI生物智藥大賽,必將吸引更多優秀的人才和團隊加入到AI制藥產業中來,不斷促進云計算和AI技術與生物醫藥研發制造深度融合,推動生物醫藥產業轉型升級,催生新業態、新模式,實現高質量發展。

審核編輯 :李倩

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原文標題:以智能算力助推AI制藥 阿里云全球AI生物智藥大賽火熱進行中

文章出處:【微信號:TheAlgorithm,微信公眾號:算法與數據結構】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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