微小RNA(miRNA)是一種約有19至24個核苷酸的非編碼RNA,具有高度保守性、時序性和組織特異性。miRNA廣泛存在于各種真核細(xì)胞中,作為基因表達的重要內(nèi)源性調(diào)控因子,與某些疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。有研究表明,乳腺癌、肺癌、前列腺癌等癌癥的共同特征是miRNA的異常表達。近年來的研究發(fā)現(xiàn),miRNA可以作為一種非侵入性的血液、尿液、唾液分析的生物標(biāo)志物,在疾病早期篩查與診斷等領(lǐng)域中具有較大應(yīng)用潛力。
然而,由于miRNA序列較短,而且各種miRNA之間相似度非常高,這些特點對檢測方法的適用性和特異性提出了要求。再加上檢測過程中復(fù)雜樣品的蛋白質(zhì)和脂質(zhì)的干擾,使得miRNA的檢測并不容易。現(xiàn)有的檢測方法通常需要復(fù)雜的程序來分離、提取和富集miRNA,常常依賴于昂貴的設(shè)備和訓(xùn)練有素的操作人員。這些要求限制了現(xiàn)有方法在資源有限的環(huán)境下對復(fù)雜生物樣本的分析應(yīng)用。因此,開發(fā)一種操作便捷、成本低廉且可靈敏檢測復(fù)雜樣本中的miRNA的方法,有助于降低miRNA檢測實驗對于環(huán)境、人員等的高要求,拓展miRNA檢測的實驗場所。
近日,首都師范大學(xué)張璐團隊基于微流控可控組裝技術(shù),設(shè)計制備出了一種探針鎖定-解鎖可轉(zhuǎn)換系統(tǒng)并將其應(yīng)用于無標(biāo)記miRNA檢測中,實現(xiàn)了miRNA的低成本、高靈敏度檢測。該論文以“Label-free microRNA detection using a locked-to-unlocked transforming system assembled by microfluidics”為題,發(fā)表在Lab on a chip期刊上。
具體而言,研究人員利用微流控技術(shù)高效合成了探針鎖定-解鎖可轉(zhuǎn)換系統(tǒng),該系統(tǒng)的核心成員是DNA序列(G4m)與鏈霉親和素磁珠(MBs)的復(fù)合物,簡稱為MBs-G4m。G4m的序列包含miRNA識別序列和富含鳥嘌呤的富G序列。G4m的兩端修飾了生物素,MBs的表面修飾了鏈霉親和素,使用微流控技術(shù)將兩者通入微通道內(nèi)進行可控結(jié)合。
經(jīng)過參數(shù)優(yōu)化,研究人員得到了G4m兩端均修飾在同一MBs表面上的復(fù)合物,即MBs-G4m。該復(fù)合物中的G4m兩端被固定,G4m中的富G序列無法自由折疊,使得體系處于探針鎖定系統(tǒng)。當(dāng)該體系遇到目標(biāo)miRNA時,MBs-G4m復(fù)合物中的miRNA識別序列會捕獲目標(biāo)miRNA,形成DNA/RNA雙鏈。
此時溶液中的雙特異性核酸酶發(fā)揮作用,將DNA/RNA雙鏈中的DNA(miRNA識別序列)降解,目標(biāo)miRNA會被釋放回溶液中進行下一次循環(huán)。降解之后,MBs-G4m復(fù)合物進入解鎖狀態(tài),G4m的一端被釋放,富G序列可以自由折疊,從而完成了由鎖定到解鎖的轉(zhuǎn)換。
在解鎖狀態(tài)下,研究人員通過磁分離技術(shù)將MBs-G4m復(fù)合物從復(fù)雜樣本中分離出來。解鎖態(tài)復(fù)合物中的富G序列可以與血紅素組裝形成G-四鏈體/血紅素DNA酶。利用該DNA酶催化底物顯色的能力,將目標(biāo)miRNA的數(shù)量信息轉(zhuǎn)換成易于測定的吸光度信息,從而實現(xiàn)了血清等復(fù)雜樣本中miRNA的定量檢測(圖1)。
圖1 (a)探針鎖定-解鎖可轉(zhuǎn)換系統(tǒng)檢測miRNA原理圖;(b)檢測miRNA的顏色變化圖
綜上所述,研究人員利用微流控技術(shù)高效合成了探針鎖定-解鎖可轉(zhuǎn)換系統(tǒng),只需2分鐘就可以制備出足夠的MBs-G4m復(fù)合物用于miRNA檢測實驗。該復(fù)合物擁有良好的磁響應(yīng)性和miRNA報告能力,可以通過磁分離減少復(fù)雜基質(zhì)中干擾組分對miRNA檢測的影響,實現(xiàn)復(fù)雜生物樣本中miRNA的準(zhǔn)確、簡便的定量分析。這種基于微流控技術(shù)快速合成探針的新檢測體系為在復(fù)雜基質(zhì)中靈敏且方便的檢測miRNA提供了一種新的思路。
審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:基于微流控組裝的探針鎖定-解鎖可轉(zhuǎn)換系統(tǒng),實現(xiàn)無標(biāo)記miRNA檢測
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