PCR概述
聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction, PCR)是一種在體外模擬DNA復制過程,擴增少量的DNA片段,從而獲得足夠數量的DNA樣本用于進一步研究的常見的分子生物學技術。該技術由美國的Kary Mullis在1983年發明,由于高度特異性和靈敏度,PCR被廣泛應用于基礎研究、疾病診斷、農業檢測和法醫鑒定等領域,而Kary Mullis也因這一發明獲得了1993年的諾貝爾化學獎。
PCR技術主要包含3個反應步驟
01 變性
模板DNA在高溫下(通常為93~94℃)變性,原來的DNA雙鏈解離成單鏈;
02 退火
反應體系的溫度降至50-65℃時,引物與單鏈互補結合;
03 延伸
在耐熱的DNA聚合酶作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,合成新鏈;
PCR技術原理示意圖
PCR分類
隨著PCR技術的不斷發展,在PCR技術原理的基礎上衍生出了多樣的PCR技術,目前常用的PCR技術主要包括以下幾類:
常規PCR
最原始和簡單的PCR方法,在PCR反應結束之后,通過凝膠電泳等方式分析PCR擴增終產物,此方法無法監測反應過程,只能在反應結束后借助電泳得到結果;
逆轉錄PCR
又稱RT-PCR,這是一種從mRNA逆轉錄獲得cDNA并擴增的技術。要進行逆轉錄PCR,需要先提取總RNA,以mRNA為模板,在逆轉錄酶的作用下合成cDNA,再以此cDNA為模板進行PCR擴增。逆轉錄PCR技術靈敏且應用廣泛,可用于檢測細胞中基因表達水平,細胞中RNA病毒含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。
RT-PCR技術原理示意圖
實時熒光定量PCR
又稱qPCR或者Real-Time PCR,是指在PCR擴增反應體系中加入熒光染料或熒光基團,通過收集熒光信號實時監測擴增產物量的變化,最后通過標準曲線和Ct值對待測樣品進行定量分析。qPCR常用的方法包括熒光染料法和熒光探針法。
qPCR的熒光染料法和熒光探針法原理示意圖
PCR常見問題
在進行PCR實驗時,可能會遇見以下常見問題:
問題描述 | 可能原因 | 解決建議 |
擴展率低 | 模板完整性較差或純度低;PCR循環數太少或延伸時間太短;變性時間過長;引物量不足; | 優化DNA模板純度;優化循環數和延伸時間;優化變性時間和溫度;優化引物濃度; |
有雜帶 | 反應緩沖液未充分混勻;引物特異性差;外源DNA污染; | 確保反應體系充分混勻;優化引物特異性;優化操作條件,確保潔凈; |
假陽性擴增 | 引物設計有問題;交叉污染; | 檢查引物序列;更換實驗耗材,清潔工作臺; |
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審核編輯黃宇
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