相信讀了上文（衰老與腫瘤研究利器：全新升級的GeoMx Digital Spatial Profiler數(shù)字空間組學檢測平臺）之后您已經(jīng)對GeoMx Digital Spatial Profiler數(shù)字空間分析儀有了一定的了解，讓我們接下來繼續(xù)了解一下DSP的應用吧~

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GeoMx DSP應用領域

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產(chǎn)品分類-RNA檢測

GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas

GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas（Hu WTA）空間全轉(zhuǎn)錄組技術實現(xiàn)了人類組織原位全轉(zhuǎn)錄組表達分析。其通過獨特的探針結構設計，大大提高了對每個轉(zhuǎn)錄本的檢測靈敏度和可信度。Hu WTA基于Human Gene Nomenclature Committee（HUGO）數(shù)據(jù)庫，同時參照National Center for Biotechnology’s Information（NCBI）RefSeq數(shù)據(jù)庫中的mRNA序列，可檢測超過18000種人類蛋白編碼基因。DSP RNA探針在保證靶標分子高特異性的基礎上，還針對多種因素進行了篩選優(yōu)化，保證每個探針都對應一個獨特的DSP條形碼。可用于下游在illumina測序儀上進行分子計數(shù)。Hu WTA采用靶向捕獲的技術原理，避免了基于poly（A）的技術局限性，從而實現(xiàn)了對于嚴重降解的組織（如FFPE）也有高靈敏度的穩(wěn)定表現(xiàn)。它能夠?qū)τ诿總€目標區(qū)域（ROI）內(nèi)的全轉(zhuǎn)錄組進行測量，幫助研究者高分辨率地探索組織微環(huán)境和細胞群之間的差異，以及背后詳細的生物通路。

產(chǎn)品亮點：

涵蓋人類全部蛋白編碼基因mRNA序列的特異性探針；

出色的檢測靈敏度：能夠在小于50um的區(qū)域內(nèi)檢測出數(shù)千個基因；

對于包括FFPE在內(nèi)的各種樣本類型均具有可靠性能，分析結果與RNA-seq和RNAScope技術驗證數(shù)據(jù)高度一致；

聯(lián)合單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）數(shù)據(jù)，可在組織原位研究不同細胞亞群；

流暢整合了illumina測序文庫制備流程和簡化的NGS數(shù)據(jù)分析方案；

出眾的靈活性，用戶可定制添加至多60個額外靶點，如非編碼RNA、合成DNA序列或者外源基因（如細菌、病毒）等；

利用GeoMx Data Suite和生物信息學工具進行空間轉(zhuǎn)錄組統(tǒng)計分析。

GeoMx Mouse Whole Transcriptome Atlas

小鼠模型在了解發(fā)育生物學、疾病發(fā)作、進展和治療方面發(fā)揮著關鍵作用。然而在小鼠轉(zhuǎn)錄組研究中，組織異質(zhì)性會增加細胞群或單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)結果的復雜性。使用GeoMx小鼠全轉(zhuǎn)錄組分析（MuWTA），研究人員可以應用空間轉(zhuǎn)錄組學來揭示小鼠模型中的組織結構和基礎功能。

產(chǎn)品亮點：

全轉(zhuǎn)錄組覆蓋度，覆蓋所有小鼠品系；

出色的靈敏度，每份樣本可檢測的基因數(shù)更多，可定量低、中和高表達基因；

穩(wěn)定可靠、可重復的結果，適用于多種樣本類型。包括FFPE、新鮮冷凍、固定冷凍和TMA樣本；

高效實現(xiàn)多樣本數(shù)據(jù)的比較，識別與生物學密切相關的特定區(qū)域或細胞群的表達變化；

標準化工作流程，運用成熟技術，無需額外驗證與優(yōu)化；

GeoMx Cancer Transcriptome Atlas

Cancer Transcriptome Atlas（CTA）支持以空間分辨率同時分析超過1,800個RNA靶標，包含細胞分析普遍應用的靶標，以及GeoMxDSP實驗的必要對照。CTA覆蓋112條對免疫應答、腫瘤生物學和微環(huán)境至關重要的通路。GeoMxCancer Transcriptome Atlas（CTA）支持全面地分析腫瘤、腫瘤微環(huán)境和腫瘤免疫狀態(tài)。

產(chǎn)品亮點：

全面的RNA檢測靶點，用于癌癥生物學研究；

廣泛覆蓋免疫應答、腫瘤微環(huán)境和腫瘤生物學研究；

包含來自臨床相關基因集，例如腫瘤炎性BC360IIO360 指數(shù)和PAM50；

超過100條通路，全方位探索癌癥；

兼容RNAscope和抗體形態(tài)學標志物；

支持增添多達60個額外的目標靶標；

流暢整合illumina高通量測序技術；

利用GeoMx Data Center進行交互式分析。

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產(chǎn)品分類-蛋白檢測

GeoMx Human Protein Assays

GeoMx Human Protein Assays 結合NGS 技術流程能夠以空間分辨率同時分析數(shù)百種蛋白質(zhì)靶標的表達。包含4種蛋白的GeoMx Protein Core for NGS包含GeoMx DSP實驗所需的對照品。GeoMx Human Protein Assays具有模塊化設計，提供經(jīng)驗證的檢測靶標，用于免疫學、腫瘤免疫學和神經(jīng)科學研究。

產(chǎn)品亮點：

經(jīng)驗證的多靶標檢測，專為免疫學、腫瘤免疫學和神經(jīng)科學等研究設計；

在10種檢測模塊中選擇并添加到GeoMx Human Protein Core，可實現(xiàn)對數(shù)百種蛋白質(zhì) 靶標的空間表達定量；

可另外定制多達10個目標抗體；

流暢整合illumina高通量檢測技術；

利用 GeoMx Data Center進行交互式分析。
責任編輯：彭菁