無線電干擾是通過對無人機的GPS系統進行干擾，或者控制無線電信號。使無人機迫降，懸停，或者返航。
1.衛星定位信號干擾
無線電干擾是目前無人機反制最主要手段。 其中可分為定向干擾或全向干擾。民用無人機一般采用的是GPS衛星定位系統,部分無人機使用GPS/GLONASS雙模衛星定位模塊來提升性能,而極少數專業級無人機會使用GPS/BD2雙模衛星定位模塊或GPS/GLONASS/BD2三模衛星定位模塊。
目前無線定位系統多采用擴頻通信技術,但無線電信號微弱時,對其進行衛星頻點干擾,阻斷無人機接收衛星定位信號。 受到干擾后無人機會出現失控或墜機現象,但此種方式同時也會對周圍的無線電通訊造成干擾"。
2.操控信號干擾
操控信號干擾方式分為遙控信號頻段阻塞干擾和跟蹤式干擾。遙控信號頻段阻塞是通過遠程對某頻段信號進行阻斷來實現無人機反制。 范圍較大，需要寬帶大的干擾設備來完成，對設備的反應速度和處理信息的能力要求高。
跟蹤式干擾可根據無人機遙控信號頻率的變動，對某一頻段進行干擾，縮小干擾范圍。對電磁環境的影響也很小。
但是這兩種干擾方式當無人機按照原先設置好的路線飛行時對無人機都沒有效果。