基于無人機高光譜影像的黑土區玉米農田土壤有機質估算
引言
東北黑土區作為我國重要的糧食生產優勢區及商品糧供給地,玉米作為其主要作物之一,每年的產量占全國總產量的30%以上。長期以來對黑土的過度開發利用導致土地退化嚴重,土壤有機質(SOM)含量作為土壤的重要組成部分,是反映土壤的肥力和質量的主要標志之一,對作物的生長發育有著顯著影響。因此,快速、精確地監測黑土區玉米關鍵生育期的SOM含量及其空間差異,在農田精準施肥、玉米長勢監測、東北黑土地保護及可持續利用等方面具有重要意義。
北黑土區長期被作物和積雪所覆蓋,為快速、精確地監測黑土區的SOM帶來了挑戰,已有學者針對東北黑土區SOM的遙感估算開展了大量研究。無人機遙感兼具時效快、低成本、高空間分辨率、不受云層影響等優點,在中小尺度的SOM估算方面受到了部分研究者的青睞。
實驗部分
2.1 研究區概況
研究區位于吉林省梨樹縣境內(圖1)四棵樹鄉的三棵樹村,地理位置43°20′17.4″N,124°0′29.1″E,屬北溫帶半濕潤大陸性季風氣候,土壤類型主要為黑土(黏化濕潤均腐土),四季分明。年均氣溫6.5℃,年日照時數2541h,作物生長期(5月—9月)內為1192h。年積溫>0℃積溫3244℃,>10℃積溫3030℃;無霜期155d。
圖1研究區的地理位置
如圖1所示,試驗田為已經進行多年的長期定位施肥試驗,設置為玉米連作區的單因子裂區試驗。裂區分別設置為傳統耕作和條耕秸稈覆蓋兩種耕作方式,每種耕作方式下包含3種施肥處理,分別為氮梯度、磷梯度和鉀梯度,每種處理設置4次重復。氮梯度為尿素(46%N)控制,其中磷肥和鉀肥施用量分別為75和90kg·hm-2,氮肥施用設置5個水平:N1(0kg·hm-2)、N2(60kg·hm-2)、N3(120kg·hm-2)、N4(180kg·hm-2)、N5(240kg·hm-2);磷肥為過磷酸鈣(18%P2O5)控制,其中氮肥和鉀肥施用量分別為180和90kg·hm-2,磷肥施用設置5個水平:P1(0kg·hm-2)、P2(25kg·hm-2)、P3(50kg·hm-2)、P4(75kg·hm-2)、P5(100kg·hm-2);鉀肥為氯化鉀(50%K2O)控制,其中氮肥和磷肥施用量分別為180和75kg·hm-2,鉀肥施用設置5個水平:K1(0kg·hm-2)、K2(30kg·hm-2)、K3(60kg·hm-2)、K4(90kg·hm-2)、K5(120kg·hm-2)。共計120個小區,小區面積為133m2,行距設置為70cm,種植密度62000株·hm-2。
2.2土壤數據的采集和分析
根據玉米的生長狀況及天氣情況,采樣時間分別為2019年玉米的拔節期(6月23日)和吐絲期(8月1日)。根據五點采樣法,在每個小區進行樣品采集,每個生育期采集120個樣本,兩生育期共計采集240個樣本,樣本采集的同時利用GPS記錄每個樣本的坐標,以便之后在高光譜數據中獲取與采樣點對應的植被冠層光譜反射率值(R)。然后在室內進行土壤樣品的稱量后磨、風干,過2mm篩,用重鉻酸鉀容量法測定SOM含量。為增加建模結果的代表性,分別進行了單生育期和兩生育期的數據分析及建模。將不同數據集按照7:3的比例進行5次隨機劃分,其中70%作為估算模型的建模集(單生育期為84個樣本,兩生育期為168個樣本),其余30%則作為驗證集(單生育期為36個樣本,兩生育期為72個樣本)。然后求取5次建模結果的平均值,使其結果更可靠。通過軟件對各生育期采樣點的SOM含量進行統計分析,結果見表1。
表1 土壤樣本有機質含量的統計特征
2.3無人機高光譜影像的采集
選擇晴朗無云,光照充足的無風或微風天氣,于北京時間10:00—15:00進行高光譜影像的采集(太陽高度角大于45°)。利用無人機搭載相機,獲取影像數據。在影像上均勻選取若干個參考點,并以此為依據進行幾何校正,確保影像誤差不超過0.5個像元,最終得到影像中各像元的光譜反射率值。
式(1)中,R目標為目標地物的反射率,DN目標為目標地物的DN均值,DN參考板為白色參考板的DN均值,R參考板為白色參考板的反射率值。
2.4無人機高光譜影像的采集
高光譜影像數據的波段數較多,其變量之間存在較為嚴 重的多重共線性。而由于作物的覆蓋使得我們無法直接獲取 土壤的光譜反射率。但土壤條件的差異會造成植被長勢的不同,最終體現在植被冠層的光譜特征上。因此利用作物冠層 的光譜指數以監測作物在不同生育期的生長特征。選取了增 強植被指 數(EVI)、可 見 光 耐 大 氣指 數(VARI)和 近 紅外/近紅外(NIR/NIR)等20種 植被指數。
SOM估算模型的構建與驗證
本文采用以下幾種模型構建并驗證結果
(1)多元逐步線性回歸模型
SMLR的基本思想是按變量的方差貢獻度,從21種協變量中逐一挑選重要變量并引入回歸模型,每次引入后都會對未選入的所有變量重新進行預測誤差判斷,使得先前剔除的變量在新變量引入后對模型在具有貢獻時又被重新選入。直至篩選出最優參數、建立最優反演模型為止,回歸方程中始終只保留重要的變量。
(2)隨機森林模型
RF是將Bagging與決策樹算法進行結合所得到的集成學習算法。該算法可以有效避免模型訓練時的過擬合現象,同時有效抑制噪聲的負面影響,有利于地物高光譜特征的綜合利用。為防止過度擬合,初始的ntree(樹的數量)設置為500,mtry(每個拆分中可供選擇的變量數量)則設置為所有自變量的個數。
(3)支持向量機模型
SVM是一種二分類模型的機器學習方法,它在高維或無限維空間中構造一個或一組超平面對樣本進行分割,可用于分類或回歸。通過不同類型的核函數(如線性、徑向、Sig-moid和多項式)實現超平面之間的良好分離。本研究選擇了線性核函數,基于帶寬代價參數和不敏感損失函數對支持向量機模型進行了調整。
(4)XGBoost模型
XGBoost是在梯度下降樹(GBDT)的基礎上對boosting算法進行改進的樹結構增強模型。其基本思想是:首先構建多個CART模型對數據集進行預測,隨后將這些樹集成為一個新的樹模型,通過不斷地迭代提升,每次迭代生成的新樹模型都會擬合前一棵樹的殘差,直到達到最佳訓練效果。
最后,選用決定系數(R2)、均方根誤差(RMSE)和歸一化均方根誤差(nRMSE)3個參數進行上述4種估算模型的精度評價。其中,R2用來評價模型的擬合優度,取值范圍在0~1之間,越接近1,說明擬合程度越好。RMSE和nRMSE用來衡量SOM預測值與觀測值之間的偏差,其值越小,說明預測效果越好。其公式如式(3)、式(4)和式(5)所示
式中:Xi和Yi分別為SOM實測值和SOM預測值;為SOM實測值的均值;為SOM預測值的均值;n為樣本數。
討論
無人機技術作為一種新型的遙感手段,兼具時效快、成本低、空間分辨率高、不受云層影響等優點,在開展精準農業研究中具有重要意義。無人機高光譜影像含有豐富的光譜信息,有研究表明其在SOM估算方面具有切實可行性,而本研究也發現在田塊尺度上進行SOM的估算可以充分發揮其作用。然而,SOM的估算研究大多集中在地形變化明顯的大范圍區域,其生物或氣候因素差異較大。本研究區尺度較小,其氣候、地形、坡度和母質等均無明顯差異,增加了SOM含量估算的難度。長期施對土壤有機質含量有著顯著影響,施用化肥(NPK)會加速SOM的分解,其SOM含量從第3年開始便下降明顯。而施用鉀肥可以提高土壤鉀,SOM對土壤鉀具有“稀釋效應”,兩者之間存在顯著的負相關關系。因此,本研究選用施肥量作為協變量參與建模,同時通過SOM與施肥量的相關分析同樣也發現SOM與施肥量具有非常顯著的負相關關系。
圖2 SOM與各波段光譜反射率的相關系數
SOM與可見光及近紅外波段之間的響應關系密切,而黑土有機質響應波段則在415~1380nm。本研究通過SOM與試驗區高光譜數據的相關分析發現,其響應波段在450~640nm處,與上述裸土的響應波段存在一定差異。由于地表植被覆蓋使得獲取地表動態反饋變得更加困難,土壤有機質與光譜反射率的關系也隨之減弱,而玉米冠層葉綠素含量較高,使得其與綠波段的相關性更強。吐絲期的SOM與光譜反射率的相關性相較于拔節期在550~640nm處的相關關系更弱,這可能是由于吐絲期相較于拔節期裸露土壤面積減少的原因。土壤有機質與光譜指數的相關性并不太顯著,可能是因為相關系數只能衡量兩個分布之間的線性相關關系,多元變量間線性或非線性的相關關系則不能完全通過相關系數來體現。但通過引入施肥量作為協變量后,發現施肥量和部分光譜指數與SOM的相關性相較于光譜指數與SOM的相關性更高。
表2 不同SOM估算模型的精度評價
同時,如表2所示,在田塊尺度下將施肥量作為協變量引入可以提高模型的R2,并降低RSME。同時,通過特征重要性評分發現,施肥量作為協變量對SOM估算的貢獻率最大,而各光譜指數的貢獻率則相對較小。
圖3 SOM與各協變量的相關系數
經過特征變量篩選后所建立的RF、SVM和XGBoost模型,根據驗證集的驗證結果發現XGBoost模型在拔節期精度(R2=0.590,RMSE=0.222,nRMSE=0.126)、吐絲期精度(R2=0.380,RMSE=0.357,nRMSE=0.197)和兩生育期組合精度(R2=0.453,RMSE=0.277,nRMSE=0.155),其估算效果均較好。有研究者利用地物光譜儀建立的蘋果果園土壤有機質估算模型,發現RF模型反演效果較好(R2為0.880,RMSE為0.142)。
圖4特征變量在不同生育期的重要性
本研究與其他研究結果相比精度較低,原因可能是由于本研究選取了不同耕作處理和不同施肥處理兩種不同處理條件相結合,且以整個小區地塊為研究基礎,增加了數據的復雜性;而本研究建立了作物覆蓋下土壤有機質的估算模型,雖然模型的精度有所降低,但是驗證了田塊尺度下以施肥量和光譜指數作為協變量所構建模型在植被覆蓋下、不同條件田塊間的適用性。
XGBoost是一種兼具線性模型求解器和樹的學習算法,同時支持列抽樣,內置了交叉驗證,相比于RF來說更具優勢。但是在優化模型時,RF模型只需要調整決策樹的數量ntree和節點數mtry兩個關鍵參數即可,XGBoost需要調整的參數則更多。為提高模型的估算精度,今后還需針對模型參數的調整進行嘗試和優化,針對田塊尺度的SOM估算還需尋找更有價值的輔助變量,建立更具代表性的SOM估算模型。同時,通過原始波段變換和不同植被指數的選取,可能會提高有機質含量與光譜特征的相關性,對模型的精度也會有所影響。此外,本工作利用高光譜影像數據估算SOM含量,僅利用了同一類型土壤的一年田間采樣數據。今后為提高估算模型的精度和適用性,需要選擇不同的黑土類
型試驗區域并累計多年試驗數據進行深入分析。
結論
(1)利用無人機高光譜影像在對SOM的估算方面具有較大潛力。在植被覆蓋條件下,當波長為450~640nm時,SOM含量與光譜反射率呈顯著相關關系。利用植被冠層的光譜特征間接估算SOM含量具有可行性。
(2)在田塊尺度下,研究區域的氣候、地形、坡度和母質等因素均無明顯差異,以施肥量和光譜指數作為協變量參與建模可實現SOM含量的精準估算。而且,將施肥量作為協變量可以提高模型的估算精度。
(3)對比4種SOM估算模型,XGBoost相較于SMLR、SVM和RF模型的精度更高,且針對拔節期SOM含量的估算能力最好。本研究可用于耕地質量評價、土壤有機碳庫估算,為農田精準施肥和東北黑土地保護及可持續利用提供理論依據與科學參考。
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