直接面向消費(fèi)者(DTC)的基因檢測(cè)不僅僅是有趣那么簡(jiǎn)單,它的有用性隨著樣本數(shù)據(jù)庫(kù)的積累,會(huì)逐漸顯露出來(lái)。
消費(fèi)級(jí)基因檢測(cè),即直接面向消費(fèi)者(DTC)的基因檢測(cè),除了針對(duì)消費(fèi)者方面的用途,隨著DTC基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)逐漸龐大起來(lái),在人體基因組學(xué)研究、藥物研發(fā)、精準(zhǔn)治療這些醫(yī)學(xué)價(jià)值毋庸置疑,在其他領(lǐng)域的價(jià)值也會(huì)逐漸被探索。
如今,直接面向消費(fèi)者(DTC)的基因檢測(cè)已經(jīng)幫助了很多嘗鮮者深入了解了祖源信息,一些服務(wù)項(xiàng)目甚至能幫助用戶找到他們失散多年的親人。截至2018年4月,超過(guò)1500萬(wàn)人接受了DTC常染色體遺傳檢測(cè)。僅2017年,DTC基因檢測(cè)公司出售的試劑盒約為700萬(wàn)。目前,幾乎所有主要的DTC基因檢測(cè)公司都使用基因芯片來(lái)檢測(cè)約700,000種基因變異,并允許受試者以純文本格式下載其原始基因型文件。但是,近日發(fā)表在《科學(xué)》雜志上的一項(xiàng)新研究表明,無(wú)論你最初是否自愿進(jìn)行過(guò)基因檢測(cè),那些上傳至DTC基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)的信息都可以用于確認(rèn)你的身份。
從“金州殺手”案到DTC基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)
這項(xiàng)研究主要受到近期“金州殺手”案件的啟發(fā)。
當(dāng)?shù)貢r(shí)間4月24日,現(xiàn)年72歲的Joseph James DeAngelo因涉嫌在上世紀(jì)70到80年代連環(huán)殺人,在美國(guó)加利福尼亞州薩克拉門(mén)托縣郊區(qū)的住所被警方帶走。數(shù)十年間,加利福尼亞州曾被一連串***案帶來(lái)的恐懼籠罩。那個(gè)后來(lái)以“金州殺手”的名號(hào)在美國(guó)的犯罪史上留下血腥一筆的兇手,在十年里強(qiáng)奸45名女性,殺害12人。如今,“殺人惡魔”終于落網(wǎng),而他曾經(jīng)還是一名警察。
嫌犯的落網(wǎng)得益于先進(jìn)的DNA技術(shù)及譜系數(shù)據(jù)庫(kù)。傳統(tǒng)的法醫(yī)學(xué)調(diào)查主要依賴于將特定的短串聯(lián)重復(fù)序列(又稱微衛(wèi)星DNA)與犯罪嫌疑人DNA進(jìn)行匹配。但這些DNA片段僅允許警方在嚴(yán)格監(jiān)管的數(shù)據(jù)庫(kù)中識(shí)別一個(gè)人或他們的近親。得益于新技術(shù)的出現(xiàn),金州殺手案的調(diào)查人員通過(guò)犯罪現(xiàn)場(chǎng)留下的DNA分離出遺傳物質(zhì),并利用DTC基因檢測(cè)公司的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了DNA匹配。這些信息以及其他歷史記錄幫助調(diào)查人員創(chuàng)建了嫌疑人及其親屬的家族譜。在對(duì)包括DeAngelo在內(nèi)的嫌疑人進(jìn)行集中調(diào)查后,調(diào)查人員從DeAngelo身上收集到了與犯罪現(xiàn)場(chǎng)DNA完全匹配的DNA樣本。
嫌犯的落網(wǎng)為跨越數(shù)十年的懸案畫(huà)上了句號(hào)。這種新型破案手段的確巧妙,但實(shí)際上,這種方法很可能帶來(lái)更為深遠(yuǎn)的影響,一些遺傳隱私專家也為新技術(shù)的使用感到憂慮。這其中便包括MyHeritage公司首席科學(xué)官、哥倫比亞大學(xué)計(jì)算遺傳學(xué)家Yaniv Erlich。MyHeritage公司成立于以色列,是一家可以提供祖源基因檢測(cè)的消費(fèi)級(jí)基因檢測(cè)公司。
在最新發(fā)表在《科學(xué)》雜志的研究中,Erlic研究團(tuán)隊(duì)希望了解,通過(guò)遠(yuǎn)房甚至未知的家庭成員DNA來(lái)識(shí)別一個(gè)人的身份是多么容易。因此,他們對(duì)超過(guò)120萬(wàn)名在MyHeritage公司進(jìn)行檢測(cè)的匿名人士進(jìn)行了研究,并且特別排除了那些在數(shù)據(jù)庫(kù)中有直系親屬的人。這一研究也是為了弄清,一名陌生人的DNA是否真的可以用來(lái)破解你的身份。
研究人員發(fā)現(xiàn),數(shù)據(jù)庫(kù)中超過(guò)一半人群可以匹配到遠(yuǎn)親,也就是第三代的表親或更遠(yuǎn)房的親屬。對(duì)于占樣本總數(shù)75%的歐洲血統(tǒng)人群,匹配結(jié)果的命中率接近60%。有15%左右的人群,研究人員還能匹配到另一名表親。與“金州殺手”調(diào)查人員相似的是,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),通過(guò)使用這些遠(yuǎn)親和其他人口統(tǒng)計(jì)的信息,而無(wú)需特別具體的信息,他們便可以相對(duì)容易地在數(shù)據(jù)庫(kù)中追溯到某人的身份,例如目標(biāo)的年齡或可能的居住地。
研究人員表示,在理論上只需要大約2%成年人在數(shù)據(jù)庫(kù)提交DNA信息,就可以追蹤到任何人的遠(yuǎn)親,進(jìn)而揭露他們的身份。
在一個(gè)具體案例中,研究人員還成功在其他項(xiàng)目中將一位匿名女性的遺傳信息進(jìn)行交叉引用,進(jìn)而找到了她的身份。這一具體案例與“金州殺手”調(diào)查人員所使用的服務(wù)網(wǎng)站相同,均為一個(gè)名為“GEDmatch”的祖源信息網(wǎng)站。在Erlich的早期的研究中,研究人員就已經(jīng)可以通過(guò)另一種依賴其丈夫的遺傳特征的方法識(shí)別出這名女性,但新方法則更為容易,所需的前期信息也更少。
2%臨界點(diǎn)個(gè)人身份或?qū)o(wú)所遁形
對(duì)于Erlich來(lái)說(shuō),這些發(fā)現(xiàn)既令人欣喜又令人恐懼。
“當(dāng)然,這是好消息。如果有人觸犯了法律,那么執(zhí)法部門(mén)便能抓住他們。但在未來(lái),隨著技術(shù)的不斷發(fā)展,可能會(huì)有人出于不正當(dāng)理由使用它。”這即包括可能試圖從其他項(xiàng)目中尋找研究對(duì)象的科研人員,也包括非法出售個(gè)人信息的公司或個(gè)人;基因歧視也是另一個(gè)潛在的一個(gè)隱患。
Erlich表示,目前也有辦法阻止DTC基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)的潛在濫用。對(duì)于美國(guó)來(lái)說(shuō),美國(guó)衛(wèi)生和人類服務(wù)部(HHS)等機(jī)構(gòu)曾對(duì)聯(lián)邦政府資助的涉及人類受試者的研究制定了相關(guān)規(guī)定。作為“通用規(guī)則”,這些指南的修訂版已于2017年在美國(guó)開(kāi)始實(shí)施,但直到2019年才會(huì)完全生效。雖然目前修改版并不認(rèn)為我們的基因組是可識(shí)別的信息,但Erlich指出,隨著技術(shù)的進(jìn)步,HHS很可以會(huì)改變這種狀態(tài)。
此外,DTC基因檢測(cè)公司也可以采取措施保護(hù)消費(fèi)者。DTC基因檢測(cè)公司可以使用加密簽名對(duì)他們發(fā)送的原始遺傳數(shù)據(jù)進(jìn)行加密。如果確認(rèn)查詢來(lái)自客戶,那么譜系服務(wù)將僅通過(guò)其數(shù)據(jù)庫(kù)運(yùn)行搜索(作為論文的補(bǔ)充,研究人員已經(jīng)在GitHub上傳了其加密簽名的演示源代碼)。在理想情況下,執(zhí)法機(jī)構(gòu)仍然可以訪問(wèn)這些服務(wù),但必須獲得明確授權(quán)。
在過(guò)去的幾個(gè)月里,美國(guó)執(zhí)法機(jī)構(gòu)已開(kāi)始利用第三方消費(fèi)者基因組學(xué)服務(wù)來(lái)追蹤嫌犯。“金州殺手”案不是第一個(gè)警方通過(guò)親屬DNA逮捕嫌犯的案件,在2018年4月至8月期間,警方已經(jīng)使用這種方法解決了十幾個(gè)類似的案例。Erlich表示:“在這些具體問(wèn)題出現(xiàn)之前,我們現(xiàn)在就需要考慮監(jiān)督和平衡的問(wèn)題。”
盡管細(xì)節(jié)還在研究中,但幾乎可以肯定的是,我們所有人的遺傳信息都需要得到保障,即使你拒絕進(jìn)行基因檢測(cè)。因?yàn)樵诶碚撋希覀兛梢詮奈粗腄NA樣本追蹤到任何人的遠(yuǎn)親,從而揭露他們的身份。而這只需要在擁有大約2%成年人群遺傳信息的數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行分析。我們與這一臨界點(diǎn)的距離終將越來(lái)越短。
“一旦達(dá)到2%,幾乎每個(gè)人都能匹配到第三代表親,而相當(dāng)一部分人能夠匹配到第二代表親”,Erlich解釋說(shuō),“我的預(yù)測(cè)是,對(duì)于歐洲血統(tǒng)人群,我們將在兩三年內(nèi)達(dá)到這個(gè)臨界值。”
這對(duì)每個(gè)人意味著什么呢?或許在不遠(yuǎn)的未來(lái),不管你是否接受過(guò)基因檢測(cè),在某個(gè)地方,總能找到你的基因痕跡,而法律保護(hù)和監(jiān)管也將基因檢測(cè)的焦點(diǎn)。
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基因檢測(cè)
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原文標(biāo)題:Science:若DTC基因檢測(cè)達(dá)2%成年人群,幾乎所有人的身份或?qū)o(wú)所遁形
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