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CTC的富集和分析方法

電子工程師 ? 來源:lq ? 2018-12-12 14:40 ? 次閱讀

近年來隨著現代醫學研究技術的進步和CTC臨床應用價值凸顯,許多研究機構和研發團隊都在推出不同的CTC檢測技術。由于血液中CTC的含量極低,目前主流的檢測方法是先捕獲(富集)后檢測,少量方法是不捕獲(富集)直接檢測。CTC檢測技術包括CTC的富集(分離)和CTC的分析鑒定(識別)。本篇文章將介紹CTC的富集和分析方法,尤其重點介紹CTC的富集方法。

1.CTC富集方法的分類和原理

人體循環系統中CTC的含量極低,腫瘤轉移患者每毫升全血中僅有1~10個CTC,因此要實現CTC的檢測對其進行分選富集是一個關鍵的步驟。CTC分選富集效果的優劣將會直接影響其后續的檢測效果,因此高純度、高靈敏性(不丟失CTC)、快速、高細胞活性的CTC分選富集是CTC臨床應用的重點和難點。

CTC的富集方法可以分為生物化學特性富集法(親和性富集法)和物理特性富集法。親和性富集法主要是根據通過細胞表面特異性表達的蛋白質生物標志物分離靶細胞,包括正向捕獲CTC的陽性富集法和負向去除白細胞的陰性富集法。物理特性富集法主要是根據CTC的大小、密度、力學和介電性能等物理特性將CTC篩選出來。

1.1親和性富集法

親和性富集法根據結合的靶細胞是CTC還是白細胞,可分為陽性富集法和陰性富集法。陽性富集法主要利用特異性抗體與腫瘤細胞表面抗原進行特異性結合來富集CTC。

CTC分為上皮細胞表型、間質細胞表型和上皮間質細胞混合表型,因此用于CTC陽性富集的特異性抗體分為識別上皮標志物、識別間質標志物和識別上皮間質標志物三種。其中,上皮標志物在正常上皮細胞和上皮腫瘤(即癌)上表達,但在間質白細胞上不存在,因此經常用于區分癌細胞和正常血細胞。上皮細胞粘附分子(EpCAM)是最常用于上皮表型CTC陽性富集的細胞表面標志物。此外,由于細胞骨架蛋白對于上皮細胞具有特異性,細胞角蛋白家族成員(即CK8,CK18和CK19)已經成為檢測具有上皮表型癌癥患者CTC的“金標準”標記物。陰性富集法也稱白細胞去除法,通常用識別CD45或CD14的特異性抗體與白細胞結合,從而去除全血中的白細胞。

除了特異性抗體,親和性結富集法的某些技術采用與CTC或白細胞表面抗原特異性結合的多肽或適配體(aptamer,一種單鏈DNA 或RNA 分子,與目的蛋白有很高的親和力和特異性)替代抗體來實現陽性或陰性富集。

生化特性富集法

資料來源:Nat Rev Cancer. 2014 Sep;14(9):623-3,寬華投研團隊整理

1.1.1 免疫磁珠技術

親和性富集法目前基于免疫磁珠技術和微流控芯片技術對CTC進行富集。免疫磁珠技術是根據免疫親和的原理,將免疫磁珠與捕獲抗體或特異性多肽(可與血液中的CTC或白細胞表面抗原相結合)相連接,隨后通過磁場即可將磁珠捕獲與未捕獲的細胞分離。

基于免疫磁珠技術的親和性富集法的原理

資料來源:寬華投研團隊整理

1.1.2 微流控芯片技術

微流控(microfluidics)是一種精確控制和操控微尺度流體,以在微納米尺度空間中對流體進行操控為主要特征的科學技術。微流控芯片是微流控技術實現的主要平臺和技術裝置,因其樣品量小、流速可控及構件透明性等特點,已被廣泛應用于CTC的分選富集中。微流體芯片技術基于親和性富集法分離CTC時,芯片內部的微通道或微結構上修飾能夠與CTC或白細胞表面抗原結合的特異性抗體或適配體,當血液流經芯片時,特異性抗體或適配體可與目的細胞表面抗原結合,隨后將CTC或白細胞粘附在芯片上,實現CTC的陽性捕獲或陰性富集。

基于微流體芯片技術的親和性富集法的原理

資料來源:生物化學與生物物理進展2015, 42(4): 301~312,寬華投研團隊整理

1.2 物理特性富集法

物理特性富集法根據物理性質來分離CTC,包括大小、密度、力學和介電性質。從大小上來看,CTC的直徑約為10-20μm,而血細胞大小為7-12μm,通過過濾可留下體積較大的CTC。從密度上來看,CTC的密度較白細胞和紅細胞密度小,通過密度梯度離心可實現CTC分離。除了大小和密度的差異,一些技術也利用CTC和血細胞之間的力學和介電性質差異來捕獲CTC。具體來說,CTC的可變形性不及血細胞。另外,CTC的膜電容通常較血細胞低,在一定強度的電場中,其遷移率與血細胞會產生差異。微流控技術除了在親和性富集法中有廣泛應用外,在物理特性富集法中也有應用。微流控芯片根據CTC與血細胞物理特性的差異,通過在芯片中設置不同的微結構單元將其從血液中分離出來,常用的微結構包括微孔、微過濾網和微柱等。

1.3 生化和物理特性相結合的方法

此外,也有一些技術將CTC的物理和生物化學特性結合起來用于CTC富集。如CTC-iChip,其基于CTC大小和表面標志物的表達情況進行CTC富集。該技術首先根據細胞大小,將較小的紅細胞和血小板過濾出去,留下白細胞和腫瘤細胞。然后,用識別EpCAM的磁珠偶聯抗體對CTC進行免疫染色,在磁場中捕獲并收集在芯片上。或者用識別CD45的磁珠偶聯抗體去除白細胞后收集CTC。

生化和物理特性相結合的富集法(以CTC-iChip為例)

2.CTC富集技術的發展歷程和趨勢

2.1 發展歷程

從技術發展史來看,CTC富集技術分為三代:第一代為基于物理特性的粗分離技術,第二代為基于生化特性的免疫磁珠技術,第三代為基于物理或生化特性的微流控芯片技術。

2.1.1 基于物理特性的粗分離技術

基于物理特性的粗分離技術通過特殊濾膜裝置、密度梯度離心將CTC分離出來。這些技術操作簡單成本低廉,不依賴細胞表面抗原的表達,捕獲的細胞數量多,但是由于CTC物理特性的異質性,難以富集到高純度的CTC。

基于物理特性的粗分離技術

2.1.2 基于生化特性的免疫磁珠技術

基于生化特性的免疫磁珠技術通過免疫磁珠偶聯的抗體或多肽正向或負向篩選出CTC。由于技術的限制,早期的磁珠只能達到微米級。隨著納米技術的發展,現在使用的磁珠大都為納米級,其增大的比表面積增加了與待測細胞的接觸幾率,更好的分散性降低了對細胞造成的機械性壓力,大大提高了CTC的富集率。最典型的基于免疫磁珠富集CTC的技術平臺是強生子公司veridex的CellSearch,其是全球目前唯一同時經過FDA和CFDA批準的用于CTC檢測的商業化產品。該產品由于檢測靈敏度不高,且無法分離活體CTC,2016年初已停產。除了CellSearch之外,也有多種技術平臺基于免疫磁珠技術捕獲CTC,如AdnaGen公司(已被Qiagen收購)的AdnaTest,Miltenyi公司的MACS,Illumina公司的MagSweeper。

用于CTC檢測的CellSearch平臺。(A)將血液吸入含有EDTA和細胞保護劑的CellSave保護管中;(B)將7.5 mL血液轉移到單獨的管中并離心以分離固體血液成分和血漿;(C)樣品放入CELLTRACKS AUTOPREP 系統中,吸出血漿并將樣品重懸于緩沖液中;(D)添加偶聯EpCAM抗體的磁性納米顆粒并與EpCAM陽性細胞結合,從而“富集”上皮來源的CTC。然后將磁珠結合的細胞與其他細胞通過磁性分離; (E)CTC用CK8,CK18和CK19抗體染色。CD45陽性染色細胞被認為是白細胞,并被排除在分析之外;(F)應用DAPI染色細胞核;(G)施加磁力以分離磁珠結合的EpCAM陽性細胞; (H)CK陽性、DAPI陽性、CD45陰性的細胞被認為是CTC用于進一步分析。

資料來源:Transl Lung Cancer Res. 2017 Aug;6(4):473-485,寬華投研團隊整理

2.1.3 微流控芯片技術

微流控芯片技術基于CTC的物理特性或生化特性或兩種特性的結合來富集CTC,所需樣品量小、流速可控而且能夠捕獲活細胞。微流控芯片技術目前已經歷了三代的發展過程:第一代芯片為以CTC-Chip為代表,第二代芯片以HB-Chip為代表,第三代芯片以CTC-iChip為代表。

微流微柱富集:該類芯片基于CTC與血細胞生化特性的差異,在芯片中設置微柱陣列將其從血液中分離出來。此類芯片以CTC-Chip為代表,該芯片是第一個使用微流體技術富集CTC的裝置。CTC-Chip由78,000個微柱陣列組成,微柱被識別EpCAM的抗體包被,微柱的幾何排列和流體流速被優化以促進細胞附著到抗體包被的柱上。除了CTC-Chip,也有一些公司開發基于微柱結構的芯片富集CTC,如Captura公司的GEDI-Chip,Biocept公司的OncoCEE。基于微柱結構的芯片由于復雜的微柱設計很難在大規模的基礎上進行高通量生產。此外,目前用于CTC檢測和表征的技術嚴重依賴于免疫細胞化學和需要高分辨率成像的其他技術,這在非透明三維微柱陣列的存在下是困難的。

第一代芯片CTC-Chip

微流表面富集:由于基于微柱結構的芯片的局限性,表面捕獲的微流體芯片被開發,這些芯片使用抗體包被的表面裝置捕獲CTC。表面捕獲裝置的簡化架構更適合于大規模生產,并且還允許制造更易于成像的透明裝置。此類芯片以HB-Chip為代表,其微流道的結構為魚骨形(HB),表面被識別EpCAM的抗體包被,血液流過一個可視通道,通道內魚骨形溝回能夠引起血液的一個輕微斡旋,從而增強了其與抗體修飾表面的接觸。與第一代CTC 芯片相比,第二代的HB芯片制作更為簡單,且可更高效地捕獲腫瘤細胞,捕獲效率約90%。后人在第二代的基礎上加上了aptamer(結合CTC表面的EpCAM),進一步提高了CTC的捕獲效率。除了HB-Chip,GEM-Chip、GO-Chip以及BioFluidica公司的Modular Sinusoidal Microsystem也都采用表面裝置捕獲CTC。使用表面捕獲裝置的一個挑戰是下游處理的靈活性,捕獲的CTC被固定在裝置的表面上,并且難以恢復以進行進一步分析。在胰蛋白酶消化后可以釋放在這些裝置中捕獲的細胞,然而胰蛋白酶很可能切割用于后續分析的許多感興趣的表面受體。

第二代芯片HB-Chip

微流免疫磁珠富集:目前已經有多家公司或研究單位應用免疫磁珠技術來解決表面捕獲裝置的局限性,該技術能很好地控制細胞捕獲與釋放。此類芯片以CTC-iChip為代表,該芯片將免疫磁珠和微流控技術結合起來用于CTC富集。CTC-iChip首先使用塑料微柱陣列將小個的紅細胞和血小板過濾出去,然后在磁場中通過“慣性聚焦”作用將較大的細胞排成一行,并使用陽性或陰性富集方法分離CTC與白細胞。CTC-iChip的捕獲效率可以高達98%,但是對于直徑較小(<8微米)的CTC并不適用。除了CTC-iChip, 也有多種芯片技術使用免疫磁珠富集CTC。如Ephesia公司的Ephesia,Cynvenio公司的LiquidBiopsy,Fluxion公司的Isoflux ,這些芯片的捕獲效率與第二代芯片相近,為90%左右。

上述芯片主要基于CTC的生化特性將其從血液中分離出來,具有特異性高的優點,能有效分選形狀、大小相似的不同種類細胞。目前大部分技術采用EpCAM作為CTC的表面特異性抗原,但是在不同的腫瘤亞型中,EpCAM的表達各不相同。依賴EpCAM的CTC分選芯片會丟失不表達或低表達EpCAM的CTC,然而這些CTC具有更大的浸潤性和侵入性。因此,缺乏公認的表面標志物限制了親和性富集在CTC分選中的應用。

為了無需依賴表面標志物,也有一些微流控芯片基于物理特性富集CTC,目前主要有基于細胞大小和變形性差異的芯片技術,基于細胞力學性質的芯片技術和基于細胞介電性質的雙向電泳技術。

基于細胞大小和變形性差異的芯片技術:該技術通過在芯片內部設計不同的小于CTC直徑的微孔、微過濾網、微柱等結構,當含有CTC的樣品流經芯片時,CTC由于直徑大而被卡在結構內,血細胞則隨緩沖液一起流出,較大的白細胞被結構捕獲時,由于CTC比白細胞變形性小,加大緩沖液流速時,白細胞被沖走,CTC則留在芯片內,從而達到分離目的。Abnova公司的ClearCellCX System就是基于此原理分離CTC的代表,該系統還可以動態監測CTC的捕獲過程。芯片主要結構由圓柱形微柱構成,每個捕獲單元由三個圓柱排列組成一個“爪形”結構。

ClearCellCX System結構示意圖

基于細胞大小和變形性差異分選CTC的優勢在于:操作過程簡單,捕獲效率高,能夠實現高通量富集,成本遠遠低于CellSearch,無需依賴表面標志物,分選出的CTC可以用多種抗體進行標志物鑒別。該方法存在的問題是僅僅基于細胞尺寸和變形性不同而進行過濾式分選,由于CTC尺寸和白細胞有重疊部分,CTC有可能會通過濾網或微柱的間隔;而且在較大的機械力作用下,CTC隨著緩沖液流過微柱或者濾網時容易破裂。這些因素會對分離純度和細胞活性造成一定影響,這類芯片在設計內部捕獲單元時應避免使用帶棱角的微柱,比如三角形、長方形、正方形等。

基于細胞力學性質的芯片技術:這些技術主要基于慣性力或確定性側向位移。基于慣性力的慣性微流技術通過使用兩種力(梯度剪切升力和管壁效應升力)在微流體裝置中應用慣性效應,基于尺寸被動地將CTC與其他血細胞分離。這些升力的大小和方向取決于通道尺寸,通道縱橫比,流速和顆粒直徑。目前該技術的商業化平臺主要有Vortex(直線型通道)和ClearCell FX(單螺旋通道)。

ClearCell FX芯片

資料來源:Lab Chip. 2014 Jan 7;14(1):128-37,寬華投研團隊整理

基于確定性側向位移設計的微流控芯片原理是芯片內具有相對于流體流動方向呈一定角度的微柱陣列,尺寸不同的顆粒在流動過程中具有不同的運動軌跡,尺寸大的顆粒會發生側向位移向一側匯聚,尺寸小的顆粒會按原軌跡運動,在芯片上設計相應的兩個出口,即可收集到相應的細胞。

基于細胞力學性質差異分選同基于細胞大小和變形性差異分選一樣,裝置簡單、無需復雜的實驗設備、成本低。樣品無需標記,不影響CTC分子特性和表面標志物;細胞在微流環境中損傷小,分選后細胞的存活率更高,可繼續培養和做后續分析。然而,由于血液的復雜性,細胞間的相互作用不容易控制,當處理細胞濃度較高的樣品時,分選效率降低。另外,該方法單純基于細胞的物理特性實現,而人體血液是高度復雜的血漿、紅白細胞、血小板、蛋白質混合物,且血液黏度是水的3倍以上,因此芯片有時容易發生堵塞現象,影響分選效率,分選出的CTCs可能存在假陽性結果。

基于細胞介電性質的雙向電泳技術:雙向電泳(DEP)是微流控芯片上一種常用的細胞分選方法,其原理是不同類型的細胞在電場中介電性質不同,所受介電力的大小和方向不同,在不同介電力作用下向不同方向移動,在電場中實現目的細胞的分選。目前,商業化的雙向電泳技術主要有ApoCell公司的ApoStream ,Silicon Biosystems公司的DEPArray。

雙向電泳法最大的優勢是可將不同癌種表面標志物表達相同、尺寸相似、形態相似的細胞分離出來。但是在較大的流速下,微弱的電泳力沒有充足時間感應流過的CTC,從而難以達到快速分選。該方法存在的另一個問題是電場力可能會對細胞活性和表面特性產生影響,不利于對CTC進行后續培養和分子特性分析。雙向電泳法分選時間長,但準確率高,因此,較適合于少量細胞的分選。

CTC富集技術的發展歷程

2.2 發展趨勢

2.2.1微流控芯片技術有望得到更廣泛應用

微流控芯片技術由于其自身特點在細胞分選方面具有一定的優勢,包括芯片體積小、速度快、通量高、操作簡便、樣品和試劑消耗低、易在芯片上集成多用途功能部件等.經過十多年的發展,該技術已經在CTC分選中越來越廣泛的應用,有望在將來成為CTC富集和檢測工具之一。該技術目前也面臨著一些技術上和臨床上的挑戰:芯片通道空間小,實驗過程中管道容易被堵塞;有些特殊的芯片造價昂貴不便于推廣應用;在進行細胞分選時,有些方法難以確保較高的細胞活性;缺乏統一的CTC表面標志物等.如何改進微流控芯片技術在進行細胞分選時所遇到的上述問題,充分發揮其優勢,將是接下來研究的關鍵。

2.2.2 開發納米技術和適配體在微流控芯片中的應用

CTC檢測的靈敏度和可靠性非常重要,7.5 ml血液中有1~5個CTC在臨床上都是有意義的,假陰性和假陽性都可能對樣品分析、臨床診斷產生重要影響。隨著納米技術的不斷發展,功能化納米材料修飾的微流控芯片廣泛應用于CTC的富集和檢測。抗體連接的功能性納米粒子能夠為CTC與抗體的結合提供更大的接觸表面積,因此納米技術也成為細胞分選中備受矚目的一項新技術。適配體能提供特異性CTC靶點,因此微流控芯片的應用也許可以向基于新的CTC捕獲探針(如核酸適配體探針等)方面發展,尋找特異性強的適配體探針,以提高CTC檢測的可靠性。

2.2.3 基于多種捕獲方法設計微流控芯片

親和性富集法特異性高,能有效分選形狀、大小相似的不同種類細胞,但是陽性富集法大都使用EpCAM,會丟失不表達或低表達EpCAM的CTC,而陰性富集法只是去除了白細胞,CTC純度不高。物理特性富集法不依賴細胞表面標志物的表達,捕獲的細胞數量多,能夠克服CTC在蛋白表達上的異質性,但是無法克服CTC在物理特性的異質性。因此,采用多種捕獲方法相結合,充分利用各自的優點設計CTC捕獲微流控芯片是將來的發展趨勢。如第三代芯片CTC-iChip,其利用確定性側向位移、慣性聚焦和免疫磁珠富集CTC。

CTC富集技術比較

3.國內外CTC公司的富集技術圖譜

國外部分CTC公司的富集技術圖譜

國外CTC公司在粗分離技術、免疫磁珠技術和微流控技術等方面均有布局,而且微流控技術應用較多。這表明國外CTC公司緊隨技術發展趨勢,有望提高CTC的捕獲效率并將CTC檢測快速應用于臨床。

國內CTC公司的富集技術圖譜

目前國內進行CTC檢測的公司大約有20多家。與國外公司類似,國內公司在粗分離技術、免疫磁珠技術和微流控技術等方面均有布局。然而不同的是,國內公司基于生化特性的富集方法主要是免疫磁珠技術,微流控技術應用較少,而基于物理特性的富集方法主要是微流控技術。這表明在微流控芯片技術方面,國內公司的應用程度低于國外公司。微流控芯片技術作為目前CTC捕獲技術發展的主要趨勢,可能會對國內液體活檢公司帶來一場技術革新和升級。除了自主研發,國內多家公司已經與國外公司達成技術引進或合作開發協議:博奧晶典和新加坡液體活檢公司Celsee合作獨家引入后者的CTC檢測技術平臺;麗珠集團與美國Cynvenio公司合資組建了專注于液體活檢的麗珠圣美;貝達藥業與美國Capio Biosciences公司合作,引入了OncoSense CTC捕獲技術。由此可見,國內CTC公司仍需要緊跟技術發展趨勢,不斷研發CTC富集技術,提高細胞的捕獲效率和純度。

4.CTC分析方法

利用親和特性或物理特性法可富集到CTC,接下來還需要結合有效的下游分析方法。一方面,由于目前CTC捕獲技術不能保證百分之百的純度,需要對所得到的細胞進行鑒定,以進一步確定CTC細胞的數目,以減少CTC數目判定的假陽性率和假陰性率。另一方面,在腫瘤的發生發展過程中,不僅CTC的數目在動態的變化,CTC所攜帶的分子標志物也在變化,通過對CTC表面標志物檢測,能夠反應腫瘤發生發展的動態變化,是研究腫瘤發生發展機制的有效策略,并能很好地指導臨床治療。常用的CTC分析技術如免疫熒光、PCR、FISH及高通量測序等。

捕獲CTC的分析(檢測)技術

資料來源:浙商證券,寬華投研團隊整理

小結

由于血液中CTC的含量極低,目前主流的檢測方法是先捕獲(富集)后檢測,少量方法是不捕獲(富集)直接檢測。CTC的富集方法主要是基于其生化特性或物理特性或兩種特性的結合,已經歷了三代的發展歷程。微流控芯片技術憑借多種優勢已經在CTC分選中得到越來越廣泛的應用,有望在將來成為CTC富集和檢測工具之一。但該技術也面臨著一些技術上和臨床上的挑戰,需要克服這些問題并充分發揮其優勢。同時也需要采用多種捕獲方法相結合,充分利用各自的優點設計CTC捕獲微流控芯片。與國外公司相比,國內公司需要緊跟技術發展趨勢,加大微流控芯片技術在CTC富集方面的應用。

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原文標題:循環腫瘤細胞的檢測方法

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    發表于 01-15 19:48
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    CTC產品結構如何改變整車架構

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